Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRA6Q16445 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRA6Q16445 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRA6Q16445 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRA6Q16445 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRA6Q16445 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRA6Q16445 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRA6Q16445 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRA6Q16445 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRA6Q16445 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRA6Q16445 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRA6Q16445 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRA6Q16445 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRA6Q16445 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRA6Q16445 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRA6Q16445 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRA6Q16445 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRA6Q16445 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRA6Q16445 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRA6Q16445 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRA6Q16445 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRA6Q16445 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABRA6Q16445 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GABRA6Q16445 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABRA6Q16445 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABRA6Q16445 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GABRA6Q16445 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GABRA6Q16445 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GABRA6Q16445 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABRA6Q16445 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABRA6Q16445 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GABRA6Q16445 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GABRA6Q16445 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABRA6Q16445 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABRA6Q16445 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABRA6Q16445 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GABRA6Q16445 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GABRA6Q16445 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GABRA6Q16445 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
GABRA6Q16445 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABRA6Q16445 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABRA6Q16445 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABRA6Q16445 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GABRA6Q16445 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABRA6Q16445 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GABRA6Q16445 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABRA6Q16445 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GABRA6Q16445 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GABRA6Q16445 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABRA6Q16445 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABRA6Q16445 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GABRA6Q16445 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABRA6Q16445 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABRA6Q16445 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GABRA6Q16445 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GABRA6Q16445 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABRA6Q16445 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GABRA6Q16445 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GABRA6Q16445 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABRA6Q16445 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABRA6Q16445 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABRA6Q16445 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GABRA6Q16445 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GABRA6Q16445 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABRA6Q16445 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABRA6Q16445 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GABRA6Q16445 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GABRA6Q16445 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRA6Q16445 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRA6Q16445 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRA6Q16445 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRA6Q16445 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRA6Q16445 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRA6Q16445 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRA6Q16445 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRA6Q16445 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRA6Q16445 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRA6Q16445 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRA6Q16445 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRA6Q16445 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRA6Q16445 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRA6Q16445 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRA6Q16445 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRA6Q16445 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRA6Q16445 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRA6Q16445 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRA6Q16445 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRA6Q16445 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRA6Q16445 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRA6Q16445 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRA6Q16445 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRA6Q16445 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRA6Q16445 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRA6Q16445 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRA6Q16445 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRA6Q16445 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRA6Q16445 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRA6Q16445 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRA6Q16445 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRA6Q16445 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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