Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGA3Q16281 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGA3Q16281 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGA3Q16281 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGA3Q16281 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNGA3Q16281 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGA3Q16281 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGA3Q16281 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGA3Q16281 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGA3Q16281 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGA3Q16281 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGA3Q16281 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGA3Q16281 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGA3Q16281 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGA3Q16281 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGA3Q16281 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGA3Q16281 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGA3Q16281 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNGA3Q16281 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNGA3Q16281 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNGA3Q16281 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGA3Q16281 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGA3Q16281 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGA3Q16281 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGA3Q16281 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGA3Q16281 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGA3Q16281 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGA3Q16281 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGA3Q16281 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGA3Q16281 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGA3Q16281 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGA3Q16281 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGA3Q16281 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGA3Q16281 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGA3Q16281 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNGA3Q16281 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNGA3Q16281 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNGA3Q16281 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNGA3Q16281 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNGA3Q16281 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNGA3Q16281 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CNGA3Q16281 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNGA3Q16281 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNGA3Q16281 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNGA3Q16281 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNGA3Q16281 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGA3Q16281 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNGA3Q16281 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNGA3Q16281 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNGA3Q16281 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNGA3Q16281 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNGA3Q16281 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNGA3Q16281 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNGA3Q16281 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CNGA3Q16281 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNGA3Q16281 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNGA3Q16281 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGA3Q16281 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGA3Q16281 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGA3Q16281 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGA3Q16281 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGA3Q16281 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGA3Q16281 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGA3Q16281 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGA3Q16281 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGA3Q16281 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGA3Q16281 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGA3Q16281 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGA3Q16281 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGA3Q16281 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGA3Q16281 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGA3Q16281 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNGA3Q16281 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNGA3Q16281 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNGA3Q16281 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGA3Q16281 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGA3Q16281 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGA3Q16281 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNGA3Q16281 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNGA3Q16281 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNGA3Q16281 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNGA3Q16281 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CNGA3Q16281 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNGA3Q16281 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGA3Q16281 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGA3Q16281 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGA3Q16281 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGA3Q16281 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNGA3Q16281 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNGA3Q16281 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNGA3Q16281 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGA3Q16281 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGA3Q16281 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGA3Q16281 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGA3Q16281 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGA3Q16281 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGA3Q16281 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGA3Q16281 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGA3Q16281 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNGA3Q16281 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
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