Protein–RNA interactions for Protein: Q15527

SURF2, Surfeit locus protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF2Q15527 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SURF2Q15527 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SURF2Q15527 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SURF2Q15527 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SURF2Q15527 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SURF2Q15527 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SURF2Q15527 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SURF2Q15527 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SURF2Q15527 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SURF2Q15527 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SURF2Q15527 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SURF2Q15527 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SURF2Q15527 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SURF2Q15527 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SURF2Q15527 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SURF2Q15527 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SURF2Q15527 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SURF2Q15527 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SURF2Q15527 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SURF2Q15527 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SURF2Q15527 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SURF2Q15527 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SURF2Q15527 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SURF2Q15527 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SURF2Q15527 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SURF2Q15527 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SURF2Q15527 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SURF2Q15527 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SURF2Q15527 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SURF2Q15527 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SURF2Q15527 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SURF2Q15527 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SURF2Q15527 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SURF2Q15527 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SURF2Q15527 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SURF2Q15527 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SURF2Q15527 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SURF2Q15527 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SURF2Q15527 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SURF2Q15527 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SURF2Q15527 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SURF2Q15527 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SURF2Q15527 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SURF2Q15527 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SURF2Q15527 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SURF2Q15527 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SURF2Q15527 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SURF2Q15527 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SURF2Q15527 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SURF2Q15527 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SURF2Q15527 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SURF2Q15527 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SURF2Q15527 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SURF2Q15527 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SURF2Q15527 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SURF2Q15527 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SURF2Q15527 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SURF2Q15527 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SURF2Q15527 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SURF2Q15527 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SURF2Q15527 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SURF2Q15527 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SURF2Q15527 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SURF2Q15527 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SURF2Q15527 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SURF2Q15527 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SURF2Q15527 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SURF2Q15527 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SURF2Q15527 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SURF2Q15527 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SURF2Q15527 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SURF2Q15527 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SURF2Q15527 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SURF2Q15527 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SURF2Q15527 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SURF2Q15527 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SURF2Q15527 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SURF2Q15527 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SURF2Q15527 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SURF2Q15527 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SURF2Q15527 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SURF2Q15527 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SURF2Q15527 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SURF2Q15527 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SURF2Q15527 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SURF2Q15527 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SURF2Q15527 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SURF2Q15527 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SURF2Q15527 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SURF2Q15527 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SURF2Q15527 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SURF2Q15527 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SURF2Q15527 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SURF2Q15527 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SURF2Q15527 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SURF2Q15527 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SURF2Q15527 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SURF2Q15527 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SURF2Q15527 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SURF2Q15527 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms