Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SKIV2LQ15477 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SKIV2LQ15477 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SKIV2LQ15477 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SKIV2LQ15477 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SKIV2LQ15477 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SKIV2LQ15477 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SKIV2LQ15477 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SKIV2LQ15477 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SKIV2LQ15477 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SKIV2LQ15477 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SKIV2LQ15477 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SKIV2LQ15477 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SKIV2LQ15477 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SKIV2LQ15477 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SKIV2LQ15477 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SKIV2LQ15477 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SKIV2LQ15477 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SKIV2LQ15477 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SKIV2LQ15477 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SKIV2LQ15477 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SKIV2LQ15477 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SKIV2LQ15477 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SKIV2LQ15477 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SKIV2LQ15477 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SKIV2LQ15477 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SKIV2LQ15477 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SKIV2LQ15477 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SKIV2LQ15477 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SKIV2LQ15477 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SKIV2LQ15477 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SKIV2LQ15477 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SKIV2LQ15477 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SKIV2LQ15477 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SKIV2LQ15477 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SKIV2LQ15477 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SKIV2LQ15477 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SKIV2LQ15477 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SKIV2LQ15477 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SKIV2LQ15477 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SKIV2LQ15477 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SKIV2LQ15477 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SKIV2LQ15477 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SKIV2LQ15477 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SKIV2LQ15477 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SKIV2LQ15477 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SKIV2LQ15477 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SKIV2LQ15477 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SKIV2LQ15477 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SKIV2LQ15477 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SKIV2LQ15477 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SKIV2LQ15477 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
SKIV2LQ15477 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SKIV2LQ15477 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SKIV2LQ15477 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SKIV2LQ15477 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SKIV2LQ15477 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SKIV2LQ15477 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SKIV2LQ15477 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SKIV2LQ15477 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SKIV2LQ15477 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SKIV2LQ15477 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SKIV2LQ15477 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SKIV2LQ15477 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SKIV2LQ15477 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SKIV2LQ15477 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SKIV2LQ15477 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SKIV2LQ15477 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SKIV2LQ15477 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SKIV2LQ15477 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SKIV2LQ15477 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SKIV2LQ15477 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SKIV2LQ15477 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SKIV2LQ15477 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SKIV2LQ15477 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SKIV2LQ15477 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SKIV2LQ15477 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SKIV2LQ15477 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SKIV2LQ15477 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SKIV2LQ15477 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SKIV2LQ15477 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SKIV2LQ15477 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SKIV2LQ15477 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SKIV2LQ15477 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SKIV2LQ15477 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SKIV2LQ15477 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SKIV2LQ15477 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SKIV2LQ15477 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SKIV2LQ15477 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SKIV2LQ15477 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SKIV2LQ15477 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SKIV2LQ15477 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SKIV2LQ15477 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SKIV2LQ15477 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SKIV2LQ15477 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SKIV2LQ15477 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SKIV2LQ15477 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SKIV2LQ15477 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SKIV2LQ15477 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SKIV2LQ15477 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms