Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SEC23AQ15436 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SEC23AQ15436 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SEC23AQ15436 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SEC23AQ15436 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SEC23AQ15436 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SEC23AQ15436 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SEC23AQ15436 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SEC23AQ15436 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SEC23AQ15436 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SEC23AQ15436 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SEC23AQ15436 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SEC23AQ15436 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SEC23AQ15436 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SEC23AQ15436 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SEC23AQ15436 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SEC23AQ15436 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SEC23AQ15436 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SEC23AQ15436 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SEC23AQ15436 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SEC23AQ15436 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SEC23AQ15436 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SEC23AQ15436 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SEC23AQ15436 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SEC23AQ15436 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SEC23AQ15436 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SEC23AQ15436 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SEC23AQ15436 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SEC23AQ15436 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SEC23AQ15436 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SEC23AQ15436 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SEC23AQ15436 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SEC23AQ15436 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SEC23AQ15436 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SEC23AQ15436 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SEC23AQ15436 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SEC23AQ15436 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SEC23AQ15436 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SEC23AQ15436 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SEC23AQ15436 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SEC23AQ15436 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SEC23AQ15436 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SEC23AQ15436 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SEC23AQ15436 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SEC23AQ15436 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SEC23AQ15436 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SEC23AQ15436 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SEC23AQ15436 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SEC23AQ15436 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SEC23AQ15436 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SEC23AQ15436 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SEC23AQ15436 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SEC23AQ15436 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SEC23AQ15436 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SEC23AQ15436 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SEC23AQ15436 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SEC23AQ15436 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SEC23AQ15436 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SEC23AQ15436 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SEC23AQ15436 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SEC23AQ15436 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SEC23AQ15436 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SEC23AQ15436 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SEC23AQ15436 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SEC23AQ15436 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SEC23AQ15436 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SEC23AQ15436 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SEC23AQ15436 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SEC23AQ15436 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SEC23AQ15436 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SEC23AQ15436 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SEC23AQ15436 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SEC23AQ15436 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SEC23AQ15436 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SEC23AQ15436 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SEC23AQ15436 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SEC23AQ15436 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SEC23AQ15436 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SEC23AQ15436 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SEC23AQ15436 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SEC23AQ15436 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SEC23AQ15436 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SEC23AQ15436 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SEC23AQ15436 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SEC23AQ15436 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SEC23AQ15436 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SEC23AQ15436 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SEC23AQ15436 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SEC23AQ15436 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SEC23AQ15436 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SEC23AQ15436 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SEC23AQ15436 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SEC23AQ15436 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SEC23AQ15436 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SEC23AQ15436 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SEC23AQ15436 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SEC23AQ15436 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEC23AQ15436 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEC23AQ15436 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEC23AQ15436 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
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