Protein–RNA interactions for Protein: Q15428

SF3A2, Splicing factor 3A subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A2Q15428 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SF3A2Q15428 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SF3A2Q15428 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SF3A2Q15428 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SF3A2Q15428 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SF3A2Q15428 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SF3A2Q15428 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SF3A2Q15428 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SF3A2Q15428 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SF3A2Q15428 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SF3A2Q15428 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SF3A2Q15428 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SF3A2Q15428 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SF3A2Q15428 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SF3A2Q15428 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SF3A2Q15428 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SF3A2Q15428 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SF3A2Q15428 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SF3A2Q15428 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SF3A2Q15428 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SF3A2Q15428 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SF3A2Q15428 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SF3A2Q15428 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SF3A2Q15428 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SF3A2Q15428 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SF3A2Q15428 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SF3A2Q15428 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SF3A2Q15428 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SF3A2Q15428 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SF3A2Q15428 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SF3A2Q15428 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SF3A2Q15428 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SF3A2Q15428 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SF3A2Q15428 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SF3A2Q15428 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SF3A2Q15428 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SF3A2Q15428 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SF3A2Q15428 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SF3A2Q15428 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SF3A2Q15428 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SF3A2Q15428 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SF3A2Q15428 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SF3A2Q15428 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SF3A2Q15428 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SF3A2Q15428 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SF3A2Q15428 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SF3A2Q15428 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SF3A2Q15428 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SF3A2Q15428 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SF3A2Q15428 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SF3A2Q15428 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SF3A2Q15428 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SF3A2Q15428 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SF3A2Q15428 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SF3A2Q15428 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SF3A2Q15428 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SF3A2Q15428 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SF3A2Q15428 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SF3A2Q15428 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SF3A2Q15428 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SF3A2Q15428 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SF3A2Q15428 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SF3A2Q15428 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SF3A2Q15428 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SF3A2Q15428 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SF3A2Q15428 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SF3A2Q15428 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SF3A2Q15428 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SF3A2Q15428 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SF3A2Q15428 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SF3A2Q15428 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SF3A2Q15428 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SF3A2Q15428 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SF3A2Q15428 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SF3A2Q15428 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SF3A2Q15428 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SF3A2Q15428 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SF3A2Q15428 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SF3A2Q15428 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SF3A2Q15428 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SF3A2Q15428 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SF3A2Q15428 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SF3A2Q15428 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SF3A2Q15428 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SF3A2Q15428 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SF3A2Q15428 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SF3A2Q15428 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SF3A2Q15428 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SF3A2Q15428 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SF3A2Q15428 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SF3A2Q15428 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SF3A2Q15428 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SF3A2Q15428 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SF3A2Q15428 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SF3A2Q15428 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SF3A2Q15428 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SF3A2Q15428 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SF3A2Q15428 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SF3A2Q15428 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SF3A2Q15428 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms