Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRD3Q15059 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRD3Q15059 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRD3Q15059 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRD3Q15059 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRD3Q15059 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRD3Q15059 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRD3Q15059 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRD3Q15059 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRD3Q15059 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRD3Q15059 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRD3Q15059 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRD3Q15059 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRD3Q15059 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRD3Q15059 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRD3Q15059 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRD3Q15059 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRD3Q15059 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
BRD3Q15059 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRD3Q15059 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRD3Q15059 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRD3Q15059 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRD3Q15059 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BRD3Q15059 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRD3Q15059 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRD3Q15059 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRD3Q15059 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRD3Q15059 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRD3Q15059 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRD3Q15059 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRD3Q15059 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRD3Q15059 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRD3Q15059 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
BRD3Q15059 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
BRD3Q15059 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRD3Q15059 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRD3Q15059 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRD3Q15059 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRD3Q15059 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRD3Q15059 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRD3Q15059 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRD3Q15059 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRD3Q15059 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRD3Q15059 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
BRD3Q15059 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRD3Q15059 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRD3Q15059 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRD3Q15059 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRD3Q15059 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRD3Q15059 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRD3Q15059 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRD3Q15059 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
BRD3Q15059 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRD3Q15059 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRD3Q15059 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRD3Q15059 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRD3Q15059 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRD3Q15059 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRD3Q15059 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRD3Q15059 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRD3Q15059 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRD3Q15059 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRD3Q15059 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRD3Q15059 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRD3Q15059 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRD3Q15059 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRD3Q15059 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRD3Q15059 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRD3Q15059 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRD3Q15059 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
BRD3Q15059 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRD3Q15059 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
BRD3Q15059 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRD3Q15059 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRD3Q15059 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRD3Q15059 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRD3Q15059 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRD3Q15059 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRD3Q15059 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRD3Q15059 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
BRD3Q15059 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRD3Q15059 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRD3Q15059 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRD3Q15059 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRD3Q15059 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRD3Q15059 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRD3Q15059 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRD3Q15059 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRD3Q15059 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRD3Q15059 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRD3Q15059 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRD3Q15059 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRD3Q15059 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
BRD3Q15059 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRD3Q15059 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRD3Q15059 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRD3Q15059 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRD3Q15059 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRD3Q15059 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRD3Q15059 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
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