Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERC3Q15034 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERC3Q15034 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERC3Q15034 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERC3Q15034 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERC3Q15034 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HERC3Q15034 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HERC3Q15034 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HERC3Q15034 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HERC3Q15034 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HERC3Q15034 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HERC3Q15034 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HERC3Q15034 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HERC3Q15034 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HERC3Q15034 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HERC3Q15034 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HERC3Q15034 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HERC3Q15034 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HERC3Q15034 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERC3Q15034 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERC3Q15034 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERC3Q15034 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERC3Q15034 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERC3Q15034 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HERC3Q15034 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HERC3Q15034 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HERC3Q15034 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HERC3Q15034 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HERC3Q15034 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HERC3Q15034 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HERC3Q15034 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HERC3Q15034 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HERC3Q15034 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HERC3Q15034 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HERC3Q15034 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERC3Q15034 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERC3Q15034 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HERC3Q15034 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERC3Q15034 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERC3Q15034 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERC3Q15034 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERC3Q15034 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERC3Q15034 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERC3Q15034 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HERC3Q15034 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HERC3Q15034 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
HERC3Q15034 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.39
HERC3Q15034 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERC3Q15034 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERC3Q15034 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERC3Q15034 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERC3Q15034 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERC3Q15034 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERC3Q15034 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERC3Q15034 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERC3Q15034 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERC3Q15034 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERC3Q15034 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERC3Q15034 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERC3Q15034 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERC3Q15034 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERC3Q15034 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERC3Q15034 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERC3Q15034 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERC3Q15034 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERC3Q15034 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERC3Q15034 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERC3Q15034 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERC3Q15034 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERC3Q15034 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERC3Q15034 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERC3Q15034 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERC3Q15034 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERC3Q15034 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERC3Q15034 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERC3Q15034 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERC3Q15034 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERC3Q15034 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERC3Q15034 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERC3Q15034 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERC3Q15034 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERC3Q15034 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERC3Q15034 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERC3Q15034 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERC3Q15034 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERC3Q15034 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERC3Q15034 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HERC3Q15034 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERC3Q15034 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERC3Q15034 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERC3Q15034 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERC3Q15034 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERC3Q15034 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERC3Q15034 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERC3Q15034 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERC3Q15034 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERC3Q15034 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HERC3Q15034 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERC3Q15034 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HERC3Q15034 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
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