Protein–RNA interactions for Protein: Q14515

SPARCL1, SPARC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPARCL1Q14515 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPARCL1Q14515 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPARCL1Q14515 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPARCL1Q14515 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPARCL1Q14515 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPARCL1Q14515 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPARCL1Q14515 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPARCL1Q14515 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPARCL1Q14515 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SPARCL1Q14515 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPARCL1Q14515 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SPARCL1Q14515 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
SPARCL1Q14515 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPARCL1Q14515 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPARCL1Q14515 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPARCL1Q14515 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPARCL1Q14515 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPARCL1Q14515 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPARCL1Q14515 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPARCL1Q14515 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPARCL1Q14515 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPARCL1Q14515 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPARCL1Q14515 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPARCL1Q14515 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPARCL1Q14515 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPARCL1Q14515 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPARCL1Q14515 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPARCL1Q14515 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPARCL1Q14515 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPARCL1Q14515 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPARCL1Q14515 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPARCL1Q14515 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SPARCL1Q14515 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPARCL1Q14515 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPARCL1Q14515 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPARCL1Q14515 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPARCL1Q14515 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPARCL1Q14515 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPARCL1Q14515 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPARCL1Q14515 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPARCL1Q14515 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPARCL1Q14515 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPARCL1Q14515 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPARCL1Q14515 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPARCL1Q14515 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPARCL1Q14515 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPARCL1Q14515 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPARCL1Q14515 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPARCL1Q14515 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPARCL1Q14515 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPARCL1Q14515 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPARCL1Q14515 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPARCL1Q14515 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPARCL1Q14515 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPARCL1Q14515 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPARCL1Q14515 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPARCL1Q14515 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SPARCL1Q14515 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPARCL1Q14515 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPARCL1Q14515 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPARCL1Q14515 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPARCL1Q14515 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPARCL1Q14515 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPARCL1Q14515 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPARCL1Q14515 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPARCL1Q14515 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPARCL1Q14515 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPARCL1Q14515 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPARCL1Q14515 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPARCL1Q14515 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPARCL1Q14515 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPARCL1Q14515 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPARCL1Q14515 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPARCL1Q14515 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SPARCL1Q14515 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPARCL1Q14515 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPARCL1Q14515 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPARCL1Q14515 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPARCL1Q14515 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SPARCL1Q14515 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SPARCL1Q14515 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPARCL1Q14515 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPARCL1Q14515 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPARCL1Q14515 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPARCL1Q14515 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPARCL1Q14515 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPARCL1Q14515 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPARCL1Q14515 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPARCL1Q14515 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SPARCL1Q14515 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPARCL1Q14515 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPARCL1Q14515 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SPARCL1Q14515 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPARCL1Q14515 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPARCL1Q14515 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPARCL1Q14515 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPARCL1Q14515 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPARCL1Q14515 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPARCL1Q14515 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPARCL1Q14515 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms