Protein–RNA interactions for Protein: Q14409

GK3P, Glycerol kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GK3PQ14409 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GK3PQ14409 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GK3PQ14409 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GK3PQ14409 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GK3PQ14409 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GK3PQ14409 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GK3PQ14409 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GK3PQ14409 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GK3PQ14409 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GK3PQ14409 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GK3PQ14409 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GK3PQ14409 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GK3PQ14409 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GK3PQ14409 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GK3PQ14409 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GK3PQ14409 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GK3PQ14409 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GK3PQ14409 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GK3PQ14409 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GK3PQ14409 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GK3PQ14409 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GK3PQ14409 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GK3PQ14409 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GK3PQ14409 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GK3PQ14409 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GK3PQ14409 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GK3PQ14409 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GK3PQ14409 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GK3PQ14409 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GK3PQ14409 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GK3PQ14409 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GK3PQ14409 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GK3PQ14409 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GK3PQ14409 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GK3PQ14409 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GK3PQ14409 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GK3PQ14409 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GK3PQ14409 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GK3PQ14409 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GK3PQ14409 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GK3PQ14409 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GK3PQ14409 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GK3PQ14409 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GK3PQ14409 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GK3PQ14409 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GK3PQ14409 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GK3PQ14409 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GK3PQ14409 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GK3PQ14409 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GK3PQ14409 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GK3PQ14409 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GK3PQ14409 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GK3PQ14409 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GK3PQ14409 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GK3PQ14409 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GK3PQ14409 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GK3PQ14409 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GK3PQ14409 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GK3PQ14409 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GK3PQ14409 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GK3PQ14409 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GK3PQ14409 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GK3PQ14409 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GK3PQ14409 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GK3PQ14409 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GK3PQ14409 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GK3PQ14409 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GK3PQ14409 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GK3PQ14409 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GK3PQ14409 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GK3PQ14409 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GK3PQ14409 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GK3PQ14409 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GK3PQ14409 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GK3PQ14409 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GK3PQ14409 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GK3PQ14409 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GK3PQ14409 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GK3PQ14409 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GK3PQ14409 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GK3PQ14409 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GK3PQ14409 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GK3PQ14409 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GK3PQ14409 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GK3PQ14409 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GK3PQ14409 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GK3PQ14409 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GK3PQ14409 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GK3PQ14409 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GK3PQ14409 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GK3PQ14409 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GK3PQ14409 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GK3PQ14409 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GK3PQ14409 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GK3PQ14409 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GK3PQ14409 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GK3PQ14409 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GK3PQ14409 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GK3PQ14409 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GK3PQ14409 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms