Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTTNQ14247 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTTNQ14247 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTTNQ14247 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTTNQ14247 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTTNQ14247 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTTNQ14247 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTTNQ14247 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTTNQ14247 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CTTNQ14247 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTTNQ14247 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTTNQ14247 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTTNQ14247 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTTNQ14247 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTTNQ14247 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CTTNQ14247 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTTNQ14247 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTTNQ14247 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTTNQ14247 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTTNQ14247 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTTNQ14247 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTTNQ14247 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTTNQ14247 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTTNQ14247 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTTNQ14247 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTTNQ14247 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTTNQ14247 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTTNQ14247 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CTTNQ14247 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTTNQ14247 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTTNQ14247 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTTNQ14247 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTTNQ14247 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTTNQ14247 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTTNQ14247 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CTTNQ14247 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTTNQ14247 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTTNQ14247 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CTTNQ14247 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTTNQ14247 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTTNQ14247 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CTTNQ14247 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTTNQ14247 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTTNQ14247 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTTNQ14247 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTTNQ14247 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTTNQ14247 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTTNQ14247 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTTNQ14247 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTTNQ14247 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTTNQ14247 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTTNQ14247 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTTNQ14247 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTTNQ14247 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTTNQ14247 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTTNQ14247 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTTNQ14247 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTTNQ14247 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTTNQ14247 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTTNQ14247 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTTNQ14247 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTTNQ14247 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTTNQ14247 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTTNQ14247 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTTNQ14247 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTTNQ14247 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTTNQ14247 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTTNQ14247 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTTNQ14247 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTTNQ14247 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTTNQ14247 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTTNQ14247 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTTNQ14247 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTTNQ14247 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CTTNQ14247 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CTTNQ14247 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CTTNQ14247 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTTNQ14247 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTTNQ14247 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTTNQ14247 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CTTNQ14247 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTTNQ14247 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTTNQ14247 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTTNQ14247 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTTNQ14247 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTTNQ14247 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTTNQ14247 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTTNQ14247 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTTNQ14247 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTTNQ14247 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTTNQ14247 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTTNQ14247 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTTNQ14247 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTTNQ14247 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTTNQ14247 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTTNQ14247 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTTNQ14247 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CTTNQ14247 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTTNQ14247 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTTNQ14247 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms