Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM53BQ14153 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM53BQ14153 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM53BQ14153 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM53BQ14153 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM53BQ14153 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM53BQ14153 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM53BQ14153 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM53BQ14153 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM53BQ14153 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM53BQ14153 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM53BQ14153 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM53BQ14153 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM53BQ14153 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM53BQ14153 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM53BQ14153 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM53BQ14153 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM53BQ14153 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM53BQ14153 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM53BQ14153 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM53BQ14153 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM53BQ14153 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM53BQ14153 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM53BQ14153 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM53BQ14153 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM53BQ14153 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM53BQ14153 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM53BQ14153 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM53BQ14153 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM53BQ14153 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM53BQ14153 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM53BQ14153 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM53BQ14153 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM53BQ14153 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM53BQ14153 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM53BQ14153 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM53BQ14153 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM53BQ14153 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM53BQ14153 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM53BQ14153 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM53BQ14153 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM53BQ14153 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM53BQ14153 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM53BQ14153 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM53BQ14153 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM53BQ14153 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM53BQ14153 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM53BQ14153 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM53BQ14153 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM53BQ14153 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM53BQ14153 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM53BQ14153 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM53BQ14153 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM53BQ14153 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM53BQ14153 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM53BQ14153 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM53BQ14153 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM53BQ14153 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM53BQ14153 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM53BQ14153 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM53BQ14153 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM53BQ14153 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM53BQ14153 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM53BQ14153 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM53BQ14153 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM53BQ14153 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM53BQ14153 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM53BQ14153 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM53BQ14153 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM53BQ14153 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM53BQ14153 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM53BQ14153 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM53BQ14153 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM53BQ14153 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM53BQ14153 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM53BQ14153 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM53BQ14153 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM53BQ14153 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM53BQ14153 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM53BQ14153 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM53BQ14153 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM53BQ14153 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM53BQ14153 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM53BQ14153 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM53BQ14153 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM53BQ14153 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM53BQ14153 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM53BQ14153 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM53BQ14153 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM53BQ14153 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM53BQ14153 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM53BQ14153 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM53BQ14153 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM53BQ14153 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM53BQ14153 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM53BQ14153 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM53BQ14153 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM53BQ14153 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM53BQ14153 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM53BQ14153 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms