Protein–RNA interactions for Protein: Q14141

SEPT6, Septin-6, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT6Q14141 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEPT6Q14141 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEPT6Q14141 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEPT6Q14141 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEPT6Q14141 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEPT6Q14141 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEPT6Q14141 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEPT6Q14141 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEPT6Q14141 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEPT6Q14141 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEPT6Q14141 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEPT6Q14141 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEPT6Q14141 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEPT6Q14141 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SEPT6Q14141 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SEPT6Q14141 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SEPT6Q14141 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEPT6Q14141 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEPT6Q14141 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEPT6Q14141 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEPT6Q14141 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEPT6Q14141 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEPT6Q14141 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEPT6Q14141 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEPT6Q14141 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SEPT6Q14141 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEPT6Q14141 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEPT6Q14141 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEPT6Q14141 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SEPT6Q14141 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEPT6Q14141 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEPT6Q14141 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEPT6Q14141 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEPT6Q14141 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEPT6Q14141 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEPT6Q14141 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEPT6Q14141 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEPT6Q14141 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEPT6Q14141 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEPT6Q14141 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEPT6Q14141 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEPT6Q14141 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEPT6Q14141 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEPT6Q14141 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEPT6Q14141 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEPT6Q14141 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEPT6Q14141 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEPT6Q14141 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEPT6Q14141 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEPT6Q14141 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEPT6Q14141 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEPT6Q14141 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEPT6Q14141 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEPT6Q14141 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEPT6Q14141 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEPT6Q14141 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEPT6Q14141 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEPT6Q14141 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEPT6Q14141 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SEPT6Q14141 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEPT6Q14141 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEPT6Q14141 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEPT6Q14141 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEPT6Q14141 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEPT6Q14141 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEPT6Q14141 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEPT6Q14141 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEPT6Q14141 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEPT6Q14141 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEPT6Q14141 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SEPT6Q14141 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEPT6Q14141 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEPT6Q14141 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEPT6Q14141 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEPT6Q14141 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEPT6Q14141 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEPT6Q14141 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEPT6Q14141 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEPT6Q14141 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEPT6Q14141 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEPT6Q14141 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEPT6Q14141 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEPT6Q14141 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEPT6Q14141 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEPT6Q14141 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEPT6Q14141 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEPT6Q14141 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEPT6Q14141 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEPT6Q14141 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEPT6Q14141 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEPT6Q14141 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEPT6Q14141 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEPT6Q14141 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEPT6Q14141 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEPT6Q14141 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEPT6Q14141 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEPT6Q14141 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEPT6Q14141 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEPT6Q14141 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEPT6Q14141 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms