Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCINQ13939 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCINQ13939 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCINQ13939 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCINQ13939 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCINQ13939 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCINQ13939 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCINQ13939 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCINQ13939 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCINQ13939 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCINQ13939 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCINQ13939 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCINQ13939 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCINQ13939 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCINQ13939 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCINQ13939 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCINQ13939 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCINQ13939 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCINQ13939 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCINQ13939 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCINQ13939 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCINQ13939 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCINQ13939 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCINQ13939 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCINQ13939 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCINQ13939 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCINQ13939 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCINQ13939 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCINQ13939 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCINQ13939 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCINQ13939 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCINQ13939 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCINQ13939 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCINQ13939 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCINQ13939 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCINQ13939 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCINQ13939 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCINQ13939 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCINQ13939 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCINQ13939 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCINQ13939 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCINQ13939 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCINQ13939 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCINQ13939 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCINQ13939 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCINQ13939 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCINQ13939 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCINQ13939 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCINQ13939 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCINQ13939 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCINQ13939 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCINQ13939 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCINQ13939 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCINQ13939 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCINQ13939 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCINQ13939 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCINQ13939 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCINQ13939 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCINQ13939 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCINQ13939 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCINQ13939 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCINQ13939 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCINQ13939 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCINQ13939 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCINQ13939 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCINQ13939 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCINQ13939 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCINQ13939 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCINQ13939 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCINQ13939 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCINQ13939 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCINQ13939 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCINQ13939 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCINQ13939 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCINQ13939 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCINQ13939 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCINQ13939 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCINQ13939 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCINQ13939 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCINQ13939 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCINQ13939 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCINQ13939 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCINQ13939 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCINQ13939 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCINQ13939 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCINQ13939 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCINQ13939 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCINQ13939 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCINQ13939 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCINQ13939 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCINQ13939 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCINQ13939 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCINQ13939 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCINQ13939 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCINQ13939 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCINQ13939 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCINQ13939 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCINQ13939 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCINQ13939 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCINQ13939 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
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