Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2H3Q13889 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2H3Q13889 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2H3Q13889 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2H3Q13889 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2H3Q13889 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2H3Q13889 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2H3Q13889 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2H3Q13889 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2H3Q13889 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2H3Q13889 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2H3Q13889 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2H3Q13889 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2H3Q13889 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2H3Q13889 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2H3Q13889 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2H3Q13889 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2H3Q13889 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2H3Q13889 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2H3Q13889 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2H3Q13889 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2H3Q13889 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2H3Q13889 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2H3Q13889 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2H3Q13889 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2H3Q13889 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2H3Q13889 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2H3Q13889 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2H3Q13889 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2H3Q13889 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2H3Q13889 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2H3Q13889 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2H3Q13889 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2H3Q13889 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2H3Q13889 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2H3Q13889 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GTF2H3Q13889 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2H3Q13889 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2H3Q13889 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2H3Q13889 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2H3Q13889 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2H3Q13889 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2H3Q13889 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2H3Q13889 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2H3Q13889 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2H3Q13889 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2H3Q13889 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2H3Q13889 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2H3Q13889 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2H3Q13889 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2H3Q13889 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2H3Q13889 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2H3Q13889 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2H3Q13889 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2H3Q13889 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2H3Q13889 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2H3Q13889 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2H3Q13889 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2H3Q13889 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2H3Q13889 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2H3Q13889 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2H3Q13889 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2H3Q13889 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2H3Q13889 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2H3Q13889 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2H3Q13889 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2H3Q13889 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2H3Q13889 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2H3Q13889 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2H3Q13889 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2H3Q13889 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2H3Q13889 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2H3Q13889 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2H3Q13889 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2H3Q13889 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2H3Q13889 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2H3Q13889 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2H3Q13889 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2H3Q13889 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2H3Q13889 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2H3Q13889 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2H3Q13889 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2H3Q13889 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2H3Q13889 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2H3Q13889 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2H3Q13889 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2H3Q13889 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2H3Q13889 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2H3Q13889 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2H3Q13889 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2H3Q13889 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GTF2H3Q13889 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2H3Q13889 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2H3Q13889 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2H3Q13889 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2H3Q13889 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2H3Q13889 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2H3Q13889 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2H3Q13889 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2H3Q13889 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
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