Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOP3AQ13472 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOP3AQ13472 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOP3AQ13472 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOP3AQ13472 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOP3AQ13472 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOP3AQ13472 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOP3AQ13472 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOP3AQ13472 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOP3AQ13472 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOP3AQ13472 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOP3AQ13472 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP3AQ13472 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP3AQ13472 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP3AQ13472 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP3AQ13472 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP3AQ13472 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP3AQ13472 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP3AQ13472 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP3AQ13472 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP3AQ13472 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP3AQ13472 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOP3AQ13472 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOP3AQ13472 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOP3AQ13472 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOP3AQ13472 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOP3AQ13472 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOP3AQ13472 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOP3AQ13472 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOP3AQ13472 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOP3AQ13472 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOP3AQ13472 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TOP3AQ13472 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOP3AQ13472 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOP3AQ13472 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOP3AQ13472 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOP3AQ13472 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOP3AQ13472 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOP3AQ13472 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOP3AQ13472 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOP3AQ13472 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOP3AQ13472 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOP3AQ13472 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOP3AQ13472 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOP3AQ13472 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOP3AQ13472 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOP3AQ13472 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOP3AQ13472 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOP3AQ13472 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TOP3AQ13472 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOP3AQ13472 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TOP3AQ13472 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOP3AQ13472 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOP3AQ13472 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOP3AQ13472 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOP3AQ13472 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOP3AQ13472 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TOP3AQ13472 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TOP3AQ13472 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TOP3AQ13472 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TOP3AQ13472 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TOP3AQ13472 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TOP3AQ13472 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TOP3AQ13472 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TOP3AQ13472 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOP3AQ13472 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOP3AQ13472 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOP3AQ13472 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOP3AQ13472 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOP3AQ13472 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOP3AQ13472 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOP3AQ13472 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOP3AQ13472 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOP3AQ13472 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOP3AQ13472 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOP3AQ13472 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOP3AQ13472 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOP3AQ13472 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TOP3AQ13472 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TOP3AQ13472 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TOP3AQ13472 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TOP3AQ13472 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TOP3AQ13472 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TOP3AQ13472 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TOP3AQ13472 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TOP3AQ13472 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TOP3AQ13472 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TOP3AQ13472 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TOP3AQ13472 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TOP3AQ13472 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TOP3AQ13472 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TOP3AQ13472 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOP3AQ13472 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOP3AQ13472 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOP3AQ13472 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TOP3AQ13472 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TOP3AQ13472 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TOP3AQ13472 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TOP3AQ13472 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TOP3AQ13472 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
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