Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXE3Q13461 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXE3Q13461 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXE3Q13461 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXE3Q13461 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXE3Q13461 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXE3Q13461 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXE3Q13461 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXE3Q13461 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXE3Q13461 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXE3Q13461 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXE3Q13461 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXE3Q13461 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXE3Q13461 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXE3Q13461 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXE3Q13461 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXE3Q13461 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXE3Q13461 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXE3Q13461 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXE3Q13461 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXE3Q13461 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXE3Q13461 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXE3Q13461 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXE3Q13461 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXE3Q13461 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXE3Q13461 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXE3Q13461 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXE3Q13461 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXE3Q13461 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXE3Q13461 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXE3Q13461 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXE3Q13461 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXE3Q13461 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXE3Q13461 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXE3Q13461 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXE3Q13461 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXE3Q13461 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXE3Q13461 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXE3Q13461 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXE3Q13461 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXE3Q13461 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXE3Q13461 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXE3Q13461 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXE3Q13461 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXE3Q13461 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXE3Q13461 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXE3Q13461 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXE3Q13461 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXE3Q13461 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXE3Q13461 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXE3Q13461 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXE3Q13461 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXE3Q13461 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXE3Q13461 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXE3Q13461 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXE3Q13461 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXE3Q13461 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXE3Q13461 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXE3Q13461 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXE3Q13461 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXE3Q13461 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXE3Q13461 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXE3Q13461 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXE3Q13461 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXE3Q13461 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXE3Q13461 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXE3Q13461 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXE3Q13461 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXE3Q13461 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXE3Q13461 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXE3Q13461 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXE3Q13461 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXE3Q13461 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXE3Q13461 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXE3Q13461 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXE3Q13461 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXE3Q13461 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXE3Q13461 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXE3Q13461 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXE3Q13461 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXE3Q13461 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FOXE3Q13461 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FOXE3Q13461 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXE3Q13461 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXE3Q13461 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXE3Q13461 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXE3Q13461 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXE3Q13461 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXE3Q13461 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXE3Q13461 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXE3Q13461 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXE3Q13461 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FOXE3Q13461 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXE3Q13461 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXE3Q13461 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXE3Q13461 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXE3Q13461 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXE3Q13461 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXE3Q13461 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXE3Q13461 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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