Protein–RNA interactions for Protein: Q13136

PPFIA1, Liprin-alpha-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA1Q13136 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPFIA1Q13136 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPFIA1Q13136 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPFIA1Q13136 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPFIA1Q13136 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPFIA1Q13136 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPFIA1Q13136 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPFIA1Q13136 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPFIA1Q13136 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPFIA1Q13136 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPFIA1Q13136 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPFIA1Q13136 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPFIA1Q13136 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PPFIA1Q13136 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPFIA1Q13136 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPFIA1Q13136 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPFIA1Q13136 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPFIA1Q13136 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPFIA1Q13136 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPFIA1Q13136 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PPFIA1Q13136 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPFIA1Q13136 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPFIA1Q13136 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPFIA1Q13136 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPFIA1Q13136 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPFIA1Q13136 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPFIA1Q13136 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPFIA1Q13136 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPFIA1Q13136 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPFIA1Q13136 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPFIA1Q13136 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PPFIA1Q13136 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPFIA1Q13136 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPFIA1Q13136 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPFIA1Q13136 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPFIA1Q13136 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPFIA1Q13136 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPFIA1Q13136 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPFIA1Q13136 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PPFIA1Q13136 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPFIA1Q13136 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPFIA1Q13136 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPFIA1Q13136 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPFIA1Q13136 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPFIA1Q13136 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPFIA1Q13136 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PPFIA1Q13136 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPFIA1Q13136 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPFIA1Q13136 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPFIA1Q13136 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPFIA1Q13136 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPFIA1Q13136 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PPFIA1Q13136 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPFIA1Q13136 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPFIA1Q13136 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPFIA1Q13136 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PPFIA1Q13136 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPFIA1Q13136 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPFIA1Q13136 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPFIA1Q13136 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPFIA1Q13136 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPFIA1Q13136 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PPFIA1Q13136 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PPFIA1Q13136 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPFIA1Q13136 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PPFIA1Q13136 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPFIA1Q13136 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPFIA1Q13136 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPFIA1Q13136 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPFIA1Q13136 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPFIA1Q13136 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPFIA1Q13136 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPFIA1Q13136 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPFIA1Q13136 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPFIA1Q13136 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPFIA1Q13136 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPFIA1Q13136 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPFIA1Q13136 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPFIA1Q13136 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPFIA1Q13136 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PPFIA1Q13136 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPFIA1Q13136 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPFIA1Q13136 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPFIA1Q13136 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPFIA1Q13136 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPFIA1Q13136 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPFIA1Q13136 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPFIA1Q13136 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPFIA1Q13136 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPFIA1Q13136 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPFIA1Q13136 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPFIA1Q13136 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPFIA1Q13136 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPFIA1Q13136 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPFIA1Q13136 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPFIA1Q13136 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPFIA1Q13136 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPFIA1Q13136 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPFIA1Q13136 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPFIA1Q13136 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
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