Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RLFQ13129 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RLFQ13129 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RLFQ13129 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RLFQ13129 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RLFQ13129 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RLFQ13129 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RLFQ13129 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RLFQ13129 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RLFQ13129 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RLFQ13129 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RLFQ13129 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RLFQ13129 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RLFQ13129 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RLFQ13129 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RLFQ13129 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RLFQ13129 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RLFQ13129 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RLFQ13129 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RLFQ13129 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RLFQ13129 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RLFQ13129 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RLFQ13129 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RLFQ13129 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RLFQ13129 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RLFQ13129 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RLFQ13129 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RLFQ13129 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RLFQ13129 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RLFQ13129 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RLFQ13129 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RLFQ13129 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
RLFQ13129 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RLFQ13129 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RLFQ13129 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RLFQ13129 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RLFQ13129 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RLFQ13129 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RLFQ13129 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RLFQ13129 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RLFQ13129 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RLFQ13129 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RLFQ13129 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RLFQ13129 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
RLFQ13129 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RLFQ13129 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RLFQ13129 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RLFQ13129 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RLFQ13129 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RLFQ13129 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RLFQ13129 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RLFQ13129 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RLFQ13129 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RLFQ13129 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RLFQ13129 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RLFQ13129 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RLFQ13129 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RLFQ13129 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RLFQ13129 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RLFQ13129 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RLFQ13129 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RLFQ13129 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RLFQ13129 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RLFQ13129 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
RLFQ13129 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RLFQ13129 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RLFQ13129 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RLFQ13129 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RLFQ13129 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RLFQ13129 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RLFQ13129 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RLFQ13129 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RLFQ13129 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RLFQ13129 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RLFQ13129 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RLFQ13129 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RLFQ13129 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RLFQ13129 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RLFQ13129 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RLFQ13129 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RLFQ13129 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RLFQ13129 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RLFQ13129 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
RLFQ13129 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
RLFQ13129 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RLFQ13129 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RLFQ13129 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RLFQ13129 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RLFQ13129 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RLFQ13129 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RLFQ13129 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RLFQ13129 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RLFQ13129 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
RLFQ13129 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RLFQ13129 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RLFQ13129 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RLFQ13129 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RLFQ13129 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RLFQ13129 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RLFQ13129 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 241.8 ms