Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EFEMP1Q12805 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
EFEMP1Q12805 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EFEMP1Q12805 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EFEMP1Q12805 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EFEMP1Q12805 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EFEMP1Q12805 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EFEMP1Q12805 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EFEMP1Q12805 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EFEMP1Q12805 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EFEMP1Q12805 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EFEMP1Q12805 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EFEMP1Q12805 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EFEMP1Q12805 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EFEMP1Q12805 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EFEMP1Q12805 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
EFEMP1Q12805 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EFEMP1Q12805 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EFEMP1Q12805 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EFEMP1Q12805 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EFEMP1Q12805 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EFEMP1Q12805 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EFEMP1Q12805 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EFEMP1Q12805 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EFEMP1Q12805 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EFEMP1Q12805 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EFEMP1Q12805 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EFEMP1Q12805 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
EFEMP1Q12805 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EFEMP1Q12805 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EFEMP1Q12805 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EFEMP1Q12805 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EFEMP1Q12805 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EFEMP1Q12805 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
EFEMP1Q12805 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
EFEMP1Q12805 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EFEMP1Q12805 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EFEMP1Q12805 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EFEMP1Q12805 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
EFEMP1Q12805 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EFEMP1Q12805 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EFEMP1Q12805 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFEMP1Q12805 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFEMP1Q12805 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
EFEMP1Q12805 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
EFEMP1Q12805 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFEMP1Q12805 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFEMP1Q12805 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFEMP1Q12805 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFEMP1Q12805 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFEMP1Q12805 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EFEMP1Q12805 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EFEMP1Q12805 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EFEMP1Q12805 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EFEMP1Q12805 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EFEMP1Q12805 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EFEMP1Q12805 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EFEMP1Q12805 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EFEMP1Q12805 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EFEMP1Q12805 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EFEMP1Q12805 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EFEMP1Q12805 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EFEMP1Q12805 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EFEMP1Q12805 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EFEMP1Q12805 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EFEMP1Q12805 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EFEMP1Q12805 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EFEMP1Q12805 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EFEMP1Q12805 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EFEMP1Q12805 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EFEMP1Q12805 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EFEMP1Q12805 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EFEMP1Q12805 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EFEMP1Q12805 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EFEMP1Q12805 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EFEMP1Q12805 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EFEMP1Q12805 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EFEMP1Q12805 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EFEMP1Q12805 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EFEMP1Q12805 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EFEMP1Q12805 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EFEMP1Q12805 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EFEMP1Q12805 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFEMP1Q12805 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFEMP1Q12805 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFEMP1Q12805 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFEMP1Q12805 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFEMP1Q12805 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFEMP1Q12805 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFEMP1Q12805 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFEMP1Q12805 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFEMP1Q12805 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFEMP1Q12805 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFEMP1Q12805 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFEMP1Q12805 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFEMP1Q12805 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EFEMP1Q12805 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EFEMP1Q12805 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EFEMP1Q12805 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EFEMP1Q12805 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
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