Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDG4

SCRN3, Secernin-3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRN3Q0VDG4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCRN3Q0VDG4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCRN3Q0VDG4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCRN3Q0VDG4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCRN3Q0VDG4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCRN3Q0VDG4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCRN3Q0VDG4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCRN3Q0VDG4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SCRN3Q0VDG4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SCRN3Q0VDG4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SCRN3Q0VDG4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCRN3Q0VDG4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCRN3Q0VDG4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCRN3Q0VDG4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCRN3Q0VDG4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCRN3Q0VDG4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCRN3Q0VDG4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCRN3Q0VDG4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCRN3Q0VDG4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCRN3Q0VDG4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCRN3Q0VDG4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCRN3Q0VDG4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCRN3Q0VDG4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCRN3Q0VDG4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCRN3Q0VDG4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCRN3Q0VDG4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCRN3Q0VDG4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCRN3Q0VDG4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCRN3Q0VDG4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCRN3Q0VDG4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCRN3Q0VDG4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCRN3Q0VDG4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCRN3Q0VDG4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCRN3Q0VDG4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCRN3Q0VDG4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCRN3Q0VDG4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCRN3Q0VDG4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCRN3Q0VDG4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCRN3Q0VDG4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCRN3Q0VDG4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCRN3Q0VDG4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCRN3Q0VDG4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCRN3Q0VDG4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCRN3Q0VDG4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCRN3Q0VDG4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCRN3Q0VDG4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCRN3Q0VDG4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCRN3Q0VDG4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCRN3Q0VDG4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCRN3Q0VDG4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCRN3Q0VDG4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCRN3Q0VDG4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCRN3Q0VDG4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCRN3Q0VDG4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCRN3Q0VDG4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCRN3Q0VDG4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCRN3Q0VDG4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCRN3Q0VDG4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCRN3Q0VDG4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCRN3Q0VDG4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCRN3Q0VDG4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCRN3Q0VDG4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCRN3Q0VDG4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCRN3Q0VDG4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCRN3Q0VDG4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCRN3Q0VDG4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCRN3Q0VDG4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCRN3Q0VDG4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCRN3Q0VDG4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCRN3Q0VDG4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCRN3Q0VDG4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCRN3Q0VDG4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCRN3Q0VDG4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCRN3Q0VDG4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCRN3Q0VDG4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SCRN3Q0VDG4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCRN3Q0VDG4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCRN3Q0VDG4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCRN3Q0VDG4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SCRN3Q0VDG4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCRN3Q0VDG4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCRN3Q0VDG4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCRN3Q0VDG4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCRN3Q0VDG4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCRN3Q0VDG4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCRN3Q0VDG4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCRN3Q0VDG4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCRN3Q0VDG4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCRN3Q0VDG4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCRN3Q0VDG4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCRN3Q0VDG4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCRN3Q0VDG4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCRN3Q0VDG4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCRN3Q0VDG4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCRN3Q0VDG4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCRN3Q0VDG4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SCRN3Q0VDG4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCRN3Q0VDG4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCRN3Q0VDG4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCRN3Q0VDG4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms