Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NIPAL4Q0D2K0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NIPAL4Q0D2K0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NIPAL4Q0D2K0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NIPAL4Q0D2K0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NIPAL4Q0D2K0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NIPAL4Q0D2K0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NIPAL4Q0D2K0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NIPAL4Q0D2K0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NIPAL4Q0D2K0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NIPAL4Q0D2K0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NIPAL4Q0D2K0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NIPAL4Q0D2K0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NIPAL4Q0D2K0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NIPAL4Q0D2K0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NIPAL4Q0D2K0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NIPAL4Q0D2K0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NIPAL4Q0D2K0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NIPAL4Q0D2K0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NIPAL4Q0D2K0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
NIPAL4Q0D2K0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NIPAL4Q0D2K0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NIPAL4Q0D2K0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NIPAL4Q0D2K0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NIPAL4Q0D2K0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NIPAL4Q0D2K0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NIPAL4Q0D2K0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NIPAL4Q0D2K0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NIPAL4Q0D2K0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NIPAL4Q0D2K0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NIPAL4Q0D2K0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NIPAL4Q0D2K0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NIPAL4Q0D2K0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NIPAL4Q0D2K0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NIPAL4Q0D2K0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NIPAL4Q0D2K0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NIPAL4Q0D2K0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NIPAL4Q0D2K0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NIPAL4Q0D2K0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NIPAL4Q0D2K0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NIPAL4Q0D2K0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NIPAL4Q0D2K0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NIPAL4Q0D2K0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NIPAL4Q0D2K0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NIPAL4Q0D2K0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NIPAL4Q0D2K0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NIPAL4Q0D2K0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NIPAL4Q0D2K0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NIPAL4Q0D2K0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NIPAL4Q0D2K0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NIPAL4Q0D2K0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NIPAL4Q0D2K0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NIPAL4Q0D2K0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NIPAL4Q0D2K0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NIPAL4Q0D2K0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NIPAL4Q0D2K0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NIPAL4Q0D2K0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NIPAL4Q0D2K0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NIPAL4Q0D2K0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NIPAL4Q0D2K0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NIPAL4Q0D2K0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NIPAL4Q0D2K0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NIPAL4Q0D2K0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NIPAL4Q0D2K0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NIPAL4Q0D2K0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NIPAL4Q0D2K0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NIPAL4Q0D2K0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NIPAL4Q0D2K0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NIPAL4Q0D2K0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NIPAL4Q0D2K0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NIPAL4Q0D2K0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NIPAL4Q0D2K0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NIPAL4Q0D2K0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NIPAL4Q0D2K0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NIPAL4Q0D2K0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NIPAL4Q0D2K0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NIPAL4Q0D2K0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NIPAL4Q0D2K0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NIPAL4Q0D2K0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NIPAL4Q0D2K0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NIPAL4Q0D2K0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NIPAL4Q0D2K0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NIPAL4Q0D2K0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NIPAL4Q0D2K0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NIPAL4Q0D2K0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NIPAL4Q0D2K0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NIPAL4Q0D2K0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NIPAL4Q0D2K0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NIPAL4Q0D2K0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NIPAL4Q0D2K0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NIPAL4Q0D2K0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NIPAL4Q0D2K0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NIPAL4Q0D2K0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NIPAL4Q0D2K0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NIPAL4Q0D2K0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NIPAL4Q0D2K0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NIPAL4Q0D2K0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NIPAL4Q0D2K0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NIPAL4Q0D2K0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NIPAL4Q0D2K0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms