Protein–RNA interactions for Protein: Q08AD1

CAMSAP2, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP2Q08AD1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CAMSAP2Q08AD1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
CAMSAP2Q08AD1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CAMSAP2Q08AD1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CAMSAP2Q08AD1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CAMSAP2Q08AD1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CAMSAP2Q08AD1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
CAMSAP2Q08AD1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CAMSAP2Q08AD1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CAMSAP2Q08AD1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CAMSAP2Q08AD1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.57
CAMSAP2Q08AD1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
CAMSAP2Q08AD1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
CAMSAP2Q08AD1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
CAMSAP2Q08AD1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC37.32■■■■□ 3.56
CAMSAP2Q08AD1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.56
CAMSAP2Q08AD1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
CAMSAP2Q08AD1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
CAMSAP2Q08AD1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
CAMSAP2Q08AD1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
CAMSAP2Q08AD1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CAMSAP2Q08AD1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
CAMSAP2Q08AD1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CAMSAP2Q08AD1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CAMSAP2Q08AD1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CAMSAP2Q08AD1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
CAMSAP2Q08AD1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CAMSAP2Q08AD1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CAMSAP2Q08AD1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CAMSAP2Q08AD1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CAMSAP2Q08AD1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CAMSAP2Q08AD1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CAMSAP2Q08AD1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CAMSAP2Q08AD1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
CAMSAP2Q08AD1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CAMSAP2Q08AD1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
CAMSAP2Q08AD1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CAMSAP2Q08AD1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CAMSAP2Q08AD1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CAMSAP2Q08AD1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CAMSAP2Q08AD1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CAMSAP2Q08AD1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CAMSAP2Q08AD1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CAMSAP2Q08AD1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
CAMSAP2Q08AD1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CAMSAP2Q08AD1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CAMSAP2Q08AD1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CAMSAP2Q08AD1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CAMSAP2Q08AD1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CAMSAP2Q08AD1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC37.2■■■■□ 3.54
CAMSAP2Q08AD1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.54
CAMSAP2Q08AD1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.54
CAMSAP2Q08AD1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC37.2■■■■□ 3.54
CAMSAP2Q08AD1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC37.2■■■■□ 3.54
CAMSAP2Q08AD1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CAMSAP2Q08AD1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CAMSAP2Q08AD1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CAMSAP2Q08AD1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CAMSAP2Q08AD1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CAMSAP2Q08AD1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CAMSAP2Q08AD1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CAMSAP2Q08AD1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CAMSAP2Q08AD1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CAMSAP2Q08AD1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CAMSAP2Q08AD1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CAMSAP2Q08AD1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
CAMSAP2Q08AD1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
CAMSAP2Q08AD1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CAMSAP2Q08AD1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CAMSAP2Q08AD1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
CAMSAP2Q08AD1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CAMSAP2Q08AD1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CAMSAP2Q08AD1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CAMSAP2Q08AD1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CAMSAP2Q08AD1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CAMSAP2Q08AD1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CAMSAP2Q08AD1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CAMSAP2Q08AD1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CAMSAP2Q08AD1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.54
CAMSAP2Q08AD1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
CAMSAP2Q08AD1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CAMSAP2Q08AD1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
CAMSAP2Q08AD1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CAMSAP2Q08AD1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
CAMSAP2Q08AD1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CAMSAP2Q08AD1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
CAMSAP2Q08AD1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CAMSAP2Q08AD1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
CAMSAP2Q08AD1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CAMSAP2Q08AD1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CAMSAP2Q08AD1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CAMSAP2Q08AD1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CAMSAP2Q08AD1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CAMSAP2Q08AD1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CAMSAP2Q08AD1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CAMSAP2Q08AD1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CAMSAP2Q08AD1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CAMSAP2Q08AD1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CAMSAP2Q08AD1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CAMSAP2Q08AD1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms