Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE4DQ08499 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE4DQ08499 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE4DQ08499 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE4DQ08499 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE4DQ08499 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE4DQ08499 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE4DQ08499 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE4DQ08499 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE4DQ08499 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE4DQ08499 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PDE4DQ08499 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE4DQ08499 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE4DQ08499 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE4DQ08499 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDE4DQ08499 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28■■■□□ 2.07
PDE4DQ08499 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PDE4DQ08499 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PDE4DQ08499 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDE4DQ08499 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PDE4DQ08499 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDE4DQ08499 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDE4DQ08499 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE4DQ08499 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE4DQ08499 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE4DQ08499 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE4DQ08499 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE4DQ08499 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE4DQ08499 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE4DQ08499 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE4DQ08499 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE4DQ08499 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE4DQ08499 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE4DQ08499 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE4DQ08499 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE4DQ08499 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE4DQ08499 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE4DQ08499 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE4DQ08499 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE4DQ08499 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE4DQ08499 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE4DQ08499 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE4DQ08499 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE4DQ08499 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PDE4DQ08499 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE4DQ08499 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE4DQ08499 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE4DQ08499 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE4DQ08499 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE4DQ08499 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE4DQ08499 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE4DQ08499 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE4DQ08499 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE4DQ08499 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE4DQ08499 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE4DQ08499 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE4DQ08499 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE4DQ08499 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE4DQ08499 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE4DQ08499 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE4DQ08499 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE4DQ08499 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE4DQ08499 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE4DQ08499 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE4DQ08499 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE4DQ08499 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE4DQ08499 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE4DQ08499 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE4DQ08499 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE4DQ08499 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE4DQ08499 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE4DQ08499 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDE4DQ08499 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDE4DQ08499 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDE4DQ08499 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDE4DQ08499 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDE4DQ08499 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PDE4DQ08499 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PDE4DQ08499 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE4DQ08499 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE4DQ08499 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE4DQ08499 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE4DQ08499 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE4DQ08499 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE4DQ08499 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE4DQ08499 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE4DQ08499 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE4DQ08499 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE4DQ08499 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE4DQ08499 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE4DQ08499 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE4DQ08499 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE4DQ08499 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE4DQ08499 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE4DQ08499 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE4DQ08499 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE4DQ08499 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE4DQ08499 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE4DQ08499 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE4DQ08499 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms