Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
GOLGA3Q08378 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
GOLGA3Q08378 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
GOLGA3Q08378 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
GOLGA3Q08378 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
GOLGA3Q08378 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
GOLGA3Q08378 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
GOLGA3Q08378 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
GOLGA3Q08378 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
GOLGA3Q08378 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
GOLGA3Q08378 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
GOLGA3Q08378 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC40.03■■■■■ 4
GOLGA3Q08378 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
GOLGA3Q08378 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
GOLGA3Q08378 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
GOLGA3Q08378 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
GOLGA3Q08378 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
GOLGA3Q08378 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC40.01■■■■■ 4
GOLGA3Q08378 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
GOLGA3Q08378 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC40.01■■■■■ 4
GOLGA3Q08378 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC40.01■■■■■ 4
GOLGA3Q08378 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
GOLGA3Q08378 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
GOLGA3Q08378 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
GOLGA3Q08378 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
GOLGA3Q08378 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
GOLGA3Q08378 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC39.99■■■■□ 3.99
GOLGA3Q08378 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
GOLGA3Q08378 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC39.98■■■■□ 3.99
GOLGA3Q08378 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
GOLGA3Q08378 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
GOLGA3Q08378 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
GOLGA3Q08378 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
GOLGA3Q08378 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
GOLGA3Q08378 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC39.95■■■■□ 3.99
GOLGA3Q08378 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
GOLGA3Q08378 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.98
GOLGA3Q08378 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
GOLGA3Q08378 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.98
GOLGA3Q08378 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC39.94■■■■□ 3.98
GOLGA3Q08378 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
GOLGA3Q08378 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC39.94■■■■□ 3.98
GOLGA3Q08378 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC39.94■■■■□ 3.98
GOLGA3Q08378 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
GOLGA3Q08378 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
GOLGA3Q08378 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
GOLGA3Q08378 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
GOLGA3Q08378 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
GOLGA3Q08378 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
GOLGA3Q08378 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
GOLGA3Q08378 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
GOLGA3Q08378 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
GOLGA3Q08378 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
GOLGA3Q08378 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
GOLGA3Q08378 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
GOLGA3Q08378 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
GOLGA3Q08378 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
GOLGA3Q08378 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
GOLGA3Q08378 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
GOLGA3Q08378 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC39.9■■■■□ 3.98
GOLGA3Q08378 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC39.9■■■■□ 3.98
GOLGA3Q08378 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
GOLGA3Q08378 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
GOLGA3Q08378 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
GOLGA3Q08378 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
GOLGA3Q08378 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
GOLGA3Q08378 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
GOLGA3Q08378 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
GOLGA3Q08378 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
GOLGA3Q08378 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
GOLGA3Q08378 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
GOLGA3Q08378 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
GOLGA3Q08378 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
GOLGA3Q08378 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
GOLGA3Q08378 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
GOLGA3Q08378 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC39.88■■■■□ 3.97
GOLGA3Q08378 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC39.88■■■■□ 3.97
GOLGA3Q08378 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
GOLGA3Q08378 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC39.87■■■■□ 3.97
GOLGA3Q08378 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC39.86■■■■□ 3.97
GOLGA3Q08378 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
GOLGA3Q08378 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
GOLGA3Q08378 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
GOLGA3Q08378 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
GOLGA3Q08378 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
GOLGA3Q08378 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC39.84■■■■□ 3.97
GOLGA3Q08378 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
GOLGA3Q08378 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
GOLGA3Q08378 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
GOLGA3Q08378 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.83■■■■□ 3.97
GOLGA3Q08378 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
GOLGA3Q08378 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
GOLGA3Q08378 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC39.82■■■■□ 3.97
GOLGA3Q08378 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
GOLGA3Q08378 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
GOLGA3Q08378 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
GOLGA3Q08378 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC39.81■■■■□ 3.96
GOLGA3Q08378 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
GOLGA3Q08378 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
GOLGA3Q08378 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms