Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC3A1Q07837 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC3A1Q07837 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC3A1Q07837 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC3A1Q07837 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC3A1Q07837 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC3A1Q07837 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC3A1Q07837 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC3A1Q07837 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC3A1Q07837 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC3A1Q07837 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC3A1Q07837 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC3A1Q07837 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC3A1Q07837 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC3A1Q07837 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC3A1Q07837 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC3A1Q07837 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC3A1Q07837 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC3A1Q07837 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC3A1Q07837 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC3A1Q07837 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC3A1Q07837 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC3A1Q07837 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC3A1Q07837 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC3A1Q07837 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC3A1Q07837 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC3A1Q07837 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC3A1Q07837 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC3A1Q07837 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC3A1Q07837 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC3A1Q07837 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC3A1Q07837 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC3A1Q07837 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC3A1Q07837 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC3A1Q07837 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC3A1Q07837 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC3A1Q07837 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC3A1Q07837 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC3A1Q07837 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC3A1Q07837 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC3A1Q07837 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC3A1Q07837 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC3A1Q07837 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC3A1Q07837 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC3A1Q07837 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC3A1Q07837 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC3A1Q07837 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC3A1Q07837 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC3A1Q07837 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC3A1Q07837 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC3A1Q07837 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC3A1Q07837 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC3A1Q07837 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC3A1Q07837 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC3A1Q07837 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC3A1Q07837 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC3A1Q07837 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC3A1Q07837 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC3A1Q07837 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC3A1Q07837 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC3A1Q07837 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC3A1Q07837 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC3A1Q07837 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC3A1Q07837 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC3A1Q07837 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC3A1Q07837 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC3A1Q07837 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC3A1Q07837 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC3A1Q07837 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC3A1Q07837 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC3A1Q07837 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC3A1Q07837 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC3A1Q07837 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC3A1Q07837 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC3A1Q07837 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC3A1Q07837 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC3A1Q07837 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC3A1Q07837 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC3A1Q07837 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC3A1Q07837 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC3A1Q07837 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC3A1Q07837 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC3A1Q07837 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC3A1Q07837 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC3A1Q07837 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC3A1Q07837 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC3A1Q07837 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC3A1Q07837 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC3A1Q07837 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC3A1Q07837 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC3A1Q07837 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC3A1Q07837 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC3A1Q07837 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC3A1Q07837 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC3A1Q07837 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC3A1Q07837 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC3A1Q07837 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC3A1Q07837 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC3A1Q07837 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC3A1Q07837 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms