Protein–RNA interactions for Protein: Q07820

MCL1, Induced myeloid leukemia cell differentiation protein Mcl-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCL1Q07820 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MCL1Q07820 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MCL1Q07820 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MCL1Q07820 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCL1Q07820 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCL1Q07820 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCL1Q07820 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCL1Q07820 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
MCL1Q07820 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCL1Q07820 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCL1Q07820 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCL1Q07820 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MCL1Q07820 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MCL1Q07820 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MCL1Q07820 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MCL1Q07820 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MCL1Q07820 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MCL1Q07820 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MCL1Q07820 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MCL1Q07820 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MCL1Q07820 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MCL1Q07820 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MCL1Q07820 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MCL1Q07820 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MCL1Q07820 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MCL1Q07820 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MCL1Q07820 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
MCL1Q07820 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MCL1Q07820 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MCL1Q07820 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MCL1Q07820 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MCL1Q07820 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MCL1Q07820 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MCL1Q07820 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MCL1Q07820 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MCL1Q07820 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MCL1Q07820 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MCL1Q07820 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MCL1Q07820 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MCL1Q07820 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MCL1Q07820 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MCL1Q07820 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MCL1Q07820 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MCL1Q07820 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MCL1Q07820 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MCL1Q07820 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MCL1Q07820 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MCL1Q07820 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MCL1Q07820 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MCL1Q07820 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MCL1Q07820 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MCL1Q07820 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MCL1Q07820 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
MCL1Q07820 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
MCL1Q07820 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MCL1Q07820 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCL1Q07820 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCL1Q07820 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCL1Q07820 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCL1Q07820 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCL1Q07820 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCL1Q07820 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCL1Q07820 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCL1Q07820 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCL1Q07820 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCL1Q07820 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCL1Q07820 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCL1Q07820 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCL1Q07820 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCL1Q07820 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCL1Q07820 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCL1Q07820 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCL1Q07820 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCL1Q07820 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCL1Q07820 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCL1Q07820 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCL1Q07820 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCL1Q07820 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCL1Q07820 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCL1Q07820 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCL1Q07820 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCL1Q07820 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCL1Q07820 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCL1Q07820 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCL1Q07820 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
MCL1Q07820 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
MCL1Q07820 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCL1Q07820 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MCL1Q07820 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCL1Q07820 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCL1Q07820 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCL1Q07820 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
MCL1Q07820 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCL1Q07820 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCL1Q07820 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCL1Q07820 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCL1Q07820 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
MCL1Q07820 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCL1Q07820 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCL1Q07820 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms