Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNG1Q06432 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNG1Q06432 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNG1Q06432 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNG1Q06432 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNG1Q06432 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNG1Q06432 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNG1Q06432 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNG1Q06432 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNG1Q06432 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNG1Q06432 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNG1Q06432 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNG1Q06432 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNG1Q06432 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNG1Q06432 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNG1Q06432 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNG1Q06432 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNG1Q06432 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNG1Q06432 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNG1Q06432 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNG1Q06432 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNG1Q06432 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNG1Q06432 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNG1Q06432 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNG1Q06432 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNG1Q06432 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNG1Q06432 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNG1Q06432 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNG1Q06432 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNG1Q06432 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNG1Q06432 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNG1Q06432 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNG1Q06432 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNG1Q06432 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNG1Q06432 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNG1Q06432 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNG1Q06432 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNG1Q06432 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNG1Q06432 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNG1Q06432 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNG1Q06432 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNG1Q06432 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNG1Q06432 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNG1Q06432 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNG1Q06432 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNG1Q06432 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNG1Q06432 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNG1Q06432 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNG1Q06432 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNG1Q06432 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNG1Q06432 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNG1Q06432 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNG1Q06432 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNG1Q06432 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNG1Q06432 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNG1Q06432 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNG1Q06432 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNG1Q06432 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNG1Q06432 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNG1Q06432 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNG1Q06432 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNG1Q06432 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNG1Q06432 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNG1Q06432 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNG1Q06432 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNG1Q06432 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNG1Q06432 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNG1Q06432 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNG1Q06432 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNG1Q06432 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNG1Q06432 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNG1Q06432 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNG1Q06432 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNG1Q06432 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNG1Q06432 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CACNG1Q06432 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNG1Q06432 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNG1Q06432 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNG1Q06432 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNG1Q06432 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNG1Q06432 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNG1Q06432 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNG1Q06432 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNG1Q06432 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNG1Q06432 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNG1Q06432 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNG1Q06432 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNG1Q06432 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNG1Q06432 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNG1Q06432 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNG1Q06432 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNG1Q06432 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNG1Q06432 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNG1Q06432 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNG1Q06432 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNG1Q06432 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNG1Q06432 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNG1Q06432 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNG1Q06432 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNG1Q06432 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms