Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
EXOSC9Q06265 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.65
EXOSC9Q06265 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
EXOSC9Q06265 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
EXOSC9Q06265 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
EXOSC9Q06265 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC31.63■■■□□ 2.65
EXOSC9Q06265 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
EXOSC9Q06265 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
EXOSC9Q06265 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
EXOSC9Q06265 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
EXOSC9Q06265 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
EXOSC9Q06265 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
EXOSC9Q06265 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
EXOSC9Q06265 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC31.6■■■□□ 2.65
EXOSC9Q06265 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
EXOSC9Q06265 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
EXOSC9Q06265 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
EXOSC9Q06265 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
EXOSC9Q06265 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
EXOSC9Q06265 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
EXOSC9Q06265 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
EXOSC9Q06265 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
EXOSC9Q06265 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
EXOSC9Q06265 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
EXOSC9Q06265 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
EXOSC9Q06265 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
EXOSC9Q06265 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
EXOSC9Q06265 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
EXOSC9Q06265 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
EXOSC9Q06265 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
EXOSC9Q06265 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
EXOSC9Q06265 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
EXOSC9Q06265 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
EXOSC9Q06265 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
EXOSC9Q06265 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
EXOSC9Q06265 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
EXOSC9Q06265 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
EXOSC9Q06265 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
EXOSC9Q06265 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
EXOSC9Q06265 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
EXOSC9Q06265 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
EXOSC9Q06265 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
EXOSC9Q06265 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
EXOSC9Q06265 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
EXOSC9Q06265 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
EXOSC9Q06265 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
EXOSC9Q06265 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
EXOSC9Q06265 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
EXOSC9Q06265 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
EXOSC9Q06265 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
EXOSC9Q06265 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
EXOSC9Q06265 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
EXOSC9Q06265 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
EXOSC9Q06265 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
EXOSC9Q06265 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
EXOSC9Q06265 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
EXOSC9Q06265 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
EXOSC9Q06265 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
EXOSC9Q06265 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
EXOSC9Q06265 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
EXOSC9Q06265 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
EXOSC9Q06265 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
EXOSC9Q06265 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
EXOSC9Q06265 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
EXOSC9Q06265 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
EXOSC9Q06265 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
EXOSC9Q06265 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
EXOSC9Q06265 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
EXOSC9Q06265 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
EXOSC9Q06265 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
EXOSC9Q06265 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
EXOSC9Q06265 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
EXOSC9Q06265 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
EXOSC9Q06265 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
EXOSC9Q06265 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
EXOSC9Q06265 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
EXOSC9Q06265 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
EXOSC9Q06265 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
EXOSC9Q06265 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
EXOSC9Q06265 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
EXOSC9Q06265 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
EXOSC9Q06265 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
EXOSC9Q06265 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
EXOSC9Q06265 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
EXOSC9Q06265 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
EXOSC9Q06265 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
EXOSC9Q06265 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
EXOSC9Q06265 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
EXOSC9Q06265 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
EXOSC9Q06265 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
EXOSC9Q06265 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
EXOSC9Q06265 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
EXOSC9Q06265 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
EXOSC9Q06265 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC31.39■■■□□ 2.62
EXOSC9Q06265 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
EXOSC9Q06265 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
EXOSC9Q06265 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.61
EXOSC9Q06265 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
EXOSC9Q06265 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
EXOSC9Q06265 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms