Protein–RNA interactions for Protein: Q04726

TLE3, Transducin-like enhancer protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE3Q04726 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLE3Q04726 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLE3Q04726 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLE3Q04726 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLE3Q04726 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TLE3Q04726 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TLE3Q04726 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TLE3Q04726 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TLE3Q04726 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TLE3Q04726 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TLE3Q04726 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TLE3Q04726 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TLE3Q04726 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TLE3Q04726 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLE3Q04726 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLE3Q04726 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLE3Q04726 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLE3Q04726 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLE3Q04726 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TLE3Q04726 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TLE3Q04726 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TLE3Q04726 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TLE3Q04726 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TLE3Q04726 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLE3Q04726 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLE3Q04726 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLE3Q04726 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLE3Q04726 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TLE3Q04726 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TLE3Q04726 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TLE3Q04726 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TLE3Q04726 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TLE3Q04726 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TLE3Q04726 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TLE3Q04726 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TLE3Q04726 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TLE3Q04726 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TLE3Q04726 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TLE3Q04726 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TLE3Q04726 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TLE3Q04726 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TLE3Q04726 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TLE3Q04726 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TLE3Q04726 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TLE3Q04726 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TLE3Q04726 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TLE3Q04726 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TLE3Q04726 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TLE3Q04726 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TLE3Q04726 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TLE3Q04726 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TLE3Q04726 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TLE3Q04726 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TLE3Q04726 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TLE3Q04726 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TLE3Q04726 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TLE3Q04726 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TLE3Q04726 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TLE3Q04726 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TLE3Q04726 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TLE3Q04726 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TLE3Q04726 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TLE3Q04726 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TLE3Q04726 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TLE3Q04726 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TLE3Q04726 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TLE3Q04726 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TLE3Q04726 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TLE3Q04726 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TLE3Q04726 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TLE3Q04726 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TLE3Q04726 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TLE3Q04726 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TLE3Q04726 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TLE3Q04726 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TLE3Q04726 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TLE3Q04726 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TLE3Q04726 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TLE3Q04726 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TLE3Q04726 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TLE3Q04726 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TLE3Q04726 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TLE3Q04726 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TLE3Q04726 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TLE3Q04726 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TLE3Q04726 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TLE3Q04726 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TLE3Q04726 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TLE3Q04726 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TLE3Q04726 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TLE3Q04726 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TLE3Q04726 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TLE3Q04726 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TLE3Q04726 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TLE3Q04726 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TLE3Q04726 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TLE3Q04726 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TLE3Q04726 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TLE3Q04726 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TLE3Q04726 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms