Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GCNT1Q02742 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GCNT1Q02742 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GCNT1Q02742 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GCNT1Q02742 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GCNT1Q02742 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GCNT1Q02742 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GCNT1Q02742 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GCNT1Q02742 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GCNT1Q02742 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GCNT1Q02742 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GCNT1Q02742 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GCNT1Q02742 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GCNT1Q02742 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GCNT1Q02742 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GCNT1Q02742 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GCNT1Q02742 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GCNT1Q02742 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GCNT1Q02742 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GCNT1Q02742 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GCNT1Q02742 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GCNT1Q02742 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GCNT1Q02742 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GCNT1Q02742 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GCNT1Q02742 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GCNT1Q02742 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GCNT1Q02742 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GCNT1Q02742 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GCNT1Q02742 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GCNT1Q02742 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GCNT1Q02742 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GCNT1Q02742 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GCNT1Q02742 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GCNT1Q02742 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GCNT1Q02742 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GCNT1Q02742 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GCNT1Q02742 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GCNT1Q02742 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GCNT1Q02742 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GCNT1Q02742 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GCNT1Q02742 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GCNT1Q02742 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GCNT1Q02742 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCNT1Q02742 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCNT1Q02742 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GCNT1Q02742 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCNT1Q02742 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCNT1Q02742 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCNT1Q02742 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCNT1Q02742 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCNT1Q02742 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCNT1Q02742 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCNT1Q02742 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCNT1Q02742 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCNT1Q02742 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCNT1Q02742 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCNT1Q02742 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCNT1Q02742 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCNT1Q02742 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCNT1Q02742 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCNT1Q02742 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCNT1Q02742 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCNT1Q02742 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCNT1Q02742 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GCNT1Q02742 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GCNT1Q02742 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GCNT1Q02742 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GCNT1Q02742 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GCNT1Q02742 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GCNT1Q02742 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GCNT1Q02742 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GCNT1Q02742 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GCNT1Q02742 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GCNT1Q02742 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GCNT1Q02742 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GCNT1Q02742 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCNT1Q02742 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCNT1Q02742 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCNT1Q02742 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCNT1Q02742 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCNT1Q02742 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCNT1Q02742 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCNT1Q02742 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCNT1Q02742 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCNT1Q02742 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCNT1Q02742 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCNT1Q02742 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCNT1Q02742 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCNT1Q02742 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCNT1Q02742 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCNT1Q02742 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCNT1Q02742 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCNT1Q02742 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GCNT1Q02742 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GCNT1Q02742 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GCNT1Q02742 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GCNT1Q02742 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GCNT1Q02742 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GCNT1Q02742 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GCNT1Q02742 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms