Protein–RNA interactions for Protein: Q02338

BDH1, D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDH1Q02338 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms