Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BNC1Q01954 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BNC1Q01954 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BNC1Q01954 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BNC1Q01954 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BNC1Q01954 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BNC1Q01954 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BNC1Q01954 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BNC1Q01954 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BNC1Q01954 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BNC1Q01954 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BNC1Q01954 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BNC1Q01954 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BNC1Q01954 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BNC1Q01954 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BNC1Q01954 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BNC1Q01954 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BNC1Q01954 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BNC1Q01954 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BNC1Q01954 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BNC1Q01954 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BNC1Q01954 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BNC1Q01954 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BNC1Q01954 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BNC1Q01954 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BNC1Q01954 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BNC1Q01954 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BNC1Q01954 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BNC1Q01954 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BNC1Q01954 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BNC1Q01954 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BNC1Q01954 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BNC1Q01954 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BNC1Q01954 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BNC1Q01954 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BNC1Q01954 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BNC1Q01954 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BNC1Q01954 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BNC1Q01954 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BNC1Q01954 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BNC1Q01954 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BNC1Q01954 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BNC1Q01954 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BNC1Q01954 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BNC1Q01954 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BNC1Q01954 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
BNC1Q01954 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BNC1Q01954 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BNC1Q01954 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BNC1Q01954 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
BNC1Q01954 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BNC1Q01954 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BNC1Q01954 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BNC1Q01954 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BNC1Q01954 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BNC1Q01954 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BNC1Q01954 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BNC1Q01954 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BNC1Q01954 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BNC1Q01954 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BNC1Q01954 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BNC1Q01954 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BNC1Q01954 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BNC1Q01954 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BNC1Q01954 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BNC1Q01954 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BNC1Q01954 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BNC1Q01954 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BNC1Q01954 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BNC1Q01954 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BNC1Q01954 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BNC1Q01954 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BNC1Q01954 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BNC1Q01954 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BNC1Q01954 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BNC1Q01954 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BNC1Q01954 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BNC1Q01954 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BNC1Q01954 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BNC1Q01954 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BNC1Q01954 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BNC1Q01954 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BNC1Q01954 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BNC1Q01954 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BNC1Q01954 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BNC1Q01954 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BNC1Q01954 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BNC1Q01954 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BNC1Q01954 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BNC1Q01954 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BNC1Q01954 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BNC1Q01954 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BNC1Q01954 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BNC1Q01954 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BNC1Q01954 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BNC1Q01954 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BNC1Q01954 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BNC1Q01954 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BNC1Q01954 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BNC1Q01954 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms