Protein–RNA interactions for Protein: Q01664

TFAP4, Transcription factor AP-4, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP4Q01664 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TFAP4Q01664 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TFAP4Q01664 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TFAP4Q01664 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TFAP4Q01664 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TFAP4Q01664 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TFAP4Q01664 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TFAP4Q01664 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TFAP4Q01664 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TFAP4Q01664 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TFAP4Q01664 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TFAP4Q01664 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TFAP4Q01664 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TFAP4Q01664 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TFAP4Q01664 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TFAP4Q01664 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TFAP4Q01664 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TFAP4Q01664 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TFAP4Q01664 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TFAP4Q01664 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TFAP4Q01664 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TFAP4Q01664 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TFAP4Q01664 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TFAP4Q01664 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TFAP4Q01664 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TFAP4Q01664 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TFAP4Q01664 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TFAP4Q01664 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TFAP4Q01664 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TFAP4Q01664 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TFAP4Q01664 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TFAP4Q01664 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TFAP4Q01664 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TFAP4Q01664 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TFAP4Q01664 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TFAP4Q01664 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TFAP4Q01664 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TFAP4Q01664 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TFAP4Q01664 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TFAP4Q01664 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TFAP4Q01664 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TFAP4Q01664 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TFAP4Q01664 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TFAP4Q01664 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TFAP4Q01664 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TFAP4Q01664 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TFAP4Q01664 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TFAP4Q01664 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TFAP4Q01664 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TFAP4Q01664 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TFAP4Q01664 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TFAP4Q01664 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TFAP4Q01664 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TFAP4Q01664 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TFAP4Q01664 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TFAP4Q01664 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TFAP4Q01664 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TFAP4Q01664 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TFAP4Q01664 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TFAP4Q01664 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TFAP4Q01664 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TFAP4Q01664 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TFAP4Q01664 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TFAP4Q01664 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TFAP4Q01664 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TFAP4Q01664 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TFAP4Q01664 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TFAP4Q01664 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TFAP4Q01664 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TFAP4Q01664 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TFAP4Q01664 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TFAP4Q01664 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TFAP4Q01664 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TFAP4Q01664 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TFAP4Q01664 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TFAP4Q01664 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TFAP4Q01664 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TFAP4Q01664 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TFAP4Q01664 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TFAP4Q01664 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TFAP4Q01664 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TFAP4Q01664 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TFAP4Q01664 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TFAP4Q01664 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TFAP4Q01664 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TFAP4Q01664 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TFAP4Q01664 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TFAP4Q01664 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TFAP4Q01664 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TFAP4Q01664 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TFAP4Q01664 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TFAP4Q01664 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TFAP4Q01664 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TFAP4Q01664 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TFAP4Q01664 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TFAP4Q01664 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TFAP4Q01664 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TFAP4Q01664 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TFAP4Q01664 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TFAP4Q01664 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms