Protein–RNA interactions for Protein: Q01453

PMP22, Peripheral myelin protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMP22Q01453 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMP22Q01453 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PMP22Q01453 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMP22Q01453 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMP22Q01453 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMP22Q01453 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMP22Q01453 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMP22Q01453 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMP22Q01453 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PMP22Q01453 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMP22Q01453 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMP22Q01453 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMP22Q01453 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PMP22Q01453 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMP22Q01453 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMP22Q01453 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMP22Q01453 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMP22Q01453 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMP22Q01453 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PMP22Q01453 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMP22Q01453 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMP22Q01453 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMP22Q01453 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMP22Q01453 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMP22Q01453 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMP22Q01453 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMP22Q01453 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PMP22Q01453 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMP22Q01453 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMP22Q01453 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMP22Q01453 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMP22Q01453 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMP22Q01453 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMP22Q01453 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMP22Q01453 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMP22Q01453 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMP22Q01453 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMP22Q01453 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMP22Q01453 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMP22Q01453 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMP22Q01453 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMP22Q01453 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMP22Q01453 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMP22Q01453 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PMP22Q01453 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMP22Q01453 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMP22Q01453 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMP22Q01453 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMP22Q01453 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMP22Q01453 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMP22Q01453 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMP22Q01453 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMP22Q01453 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMP22Q01453 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMP22Q01453 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMP22Q01453 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMP22Q01453 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PMP22Q01453 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMP22Q01453 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMP22Q01453 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMP22Q01453 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PMP22Q01453 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PMP22Q01453 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PMP22Q01453 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PMP22Q01453 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMP22Q01453 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMP22Q01453 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMP22Q01453 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMP22Q01453 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMP22Q01453 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMP22Q01453 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMP22Q01453 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMP22Q01453 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMP22Q01453 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMP22Q01453 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMP22Q01453 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMP22Q01453 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMP22Q01453 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMP22Q01453 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMP22Q01453 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMP22Q01453 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMP22Q01453 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMP22Q01453 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMP22Q01453 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMP22Q01453 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMP22Q01453 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMP22Q01453 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMP22Q01453 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PMP22Q01453 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMP22Q01453 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMP22Q01453 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMP22Q01453 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMP22Q01453 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMP22Q01453 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMP22Q01453 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMP22Q01453 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMP22Q01453 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMP22Q01453 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMP22Q01453 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMP22Q01453 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms