Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RBP5P82980 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RBP5P82980 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RBP5P82980 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RBP5P82980 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RBP5P82980 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RBP5P82980 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RBP5P82980 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RBP5P82980 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RBP5P82980 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RBP5P82980 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RBP5P82980 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RBP5P82980 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RBP5P82980 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RBP5P82980 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RBP5P82980 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RBP5P82980 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RBP5P82980 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RBP5P82980 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RBP5P82980 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RBP5P82980 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RBP5P82980 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RBP5P82980 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RBP5P82980 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RBP5P82980 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RBP5P82980 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RBP5P82980 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RBP5P82980 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RBP5P82980 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RBP5P82980 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RBP5P82980 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RBP5P82980 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RBP5P82980 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RBP5P82980 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RBP5P82980 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RBP5P82980 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RBP5P82980 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RBP5P82980 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RBP5P82980 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RBP5P82980 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RBP5P82980 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RBP5P82980 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RBP5P82980 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RBP5P82980 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RBP5P82980 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RBP5P82980 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RBP5P82980 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RBP5P82980 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RBP5P82980 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RBP5P82980 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RBP5P82980 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RBP5P82980 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RBP5P82980 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBP5P82980 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBP5P82980 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBP5P82980 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBP5P82980 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBP5P82980 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBP5P82980 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBP5P82980 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RBP5P82980 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RBP5P82980 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RBP5P82980 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RBP5P82980 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBP5P82980 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBP5P82980 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBP5P82980 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBP5P82980 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBP5P82980 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBP5P82980 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBP5P82980 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBP5P82980 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBP5P82980 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBP5P82980 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBP5P82980 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RBP5P82980 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RBP5P82980 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBP5P82980 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBP5P82980 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBP5P82980 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBP5P82980 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBP5P82980 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBP5P82980 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBP5P82980 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBP5P82980 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBP5P82980 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBP5P82980 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBP5P82980 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBP5P82980 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBP5P82980 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBP5P82980 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBP5P82980 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBP5P82980 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBP5P82980 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBP5P82980 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBP5P82980 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBP5P82980 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBP5P82980 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBP5P82980 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBP5P82980 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms