Protein–RNA interactions for Protein: P78549

NTHL1, Endonuclease III-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTHL1P78549 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NTHL1P78549 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NTHL1P78549 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NTHL1P78549 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NTHL1P78549 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NTHL1P78549 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NTHL1P78549 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NTHL1P78549 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NTHL1P78549 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NTHL1P78549 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NTHL1P78549 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NTHL1P78549 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NTHL1P78549 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NTHL1P78549 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NTHL1P78549 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NTHL1P78549 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NTHL1P78549 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NTHL1P78549 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NTHL1P78549 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NTHL1P78549 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NTHL1P78549 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NTHL1P78549 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NTHL1P78549 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NTHL1P78549 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NTHL1P78549 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NTHL1P78549 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NTHL1P78549 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NTHL1P78549 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
NTHL1P78549 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NTHL1P78549 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NTHL1P78549 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NTHL1P78549 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NTHL1P78549 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NTHL1P78549 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NTHL1P78549 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NTHL1P78549 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NTHL1P78549 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NTHL1P78549 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NTHL1P78549 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NTHL1P78549 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NTHL1P78549 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NTHL1P78549 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NTHL1P78549 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NTHL1P78549 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NTHL1P78549 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NTHL1P78549 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NTHL1P78549 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NTHL1P78549 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NTHL1P78549 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NTHL1P78549 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NTHL1P78549 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NTHL1P78549 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NTHL1P78549 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NTHL1P78549 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NTHL1P78549 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NTHL1P78549 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NTHL1P78549 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NTHL1P78549 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NTHL1P78549 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NTHL1P78549 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NTHL1P78549 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NTHL1P78549 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NTHL1P78549 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NTHL1P78549 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NTHL1P78549 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NTHL1P78549 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NTHL1P78549 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NTHL1P78549 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NTHL1P78549 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NTHL1P78549 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NTHL1P78549 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NTHL1P78549 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NTHL1P78549 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NTHL1P78549 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NTHL1P78549 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NTHL1P78549 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NTHL1P78549 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NTHL1P78549 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NTHL1P78549 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NTHL1P78549 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NTHL1P78549 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NTHL1P78549 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NTHL1P78549 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NTHL1P78549 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NTHL1P78549 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NTHL1P78549 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NTHL1P78549 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NTHL1P78549 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NTHL1P78549 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NTHL1P78549 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NTHL1P78549 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NTHL1P78549 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NTHL1P78549 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NTHL1P78549 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NTHL1P78549 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NTHL1P78549 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NTHL1P78549 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NTHL1P78549 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NTHL1P78549 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NTHL1P78549 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms