Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PITX1P78337 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PITX1P78337 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PITX1P78337 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PITX1P78337 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PITX1P78337 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PITX1P78337 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PITX1P78337 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PITX1P78337 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PITX1P78337 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PITX1P78337 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PITX1P78337 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PITX1P78337 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PITX1P78337 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PITX1P78337 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PITX1P78337 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PITX1P78337 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PITX1P78337 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PITX1P78337 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PITX1P78337 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PITX1P78337 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PITX1P78337 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PITX1P78337 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PITX1P78337 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PITX1P78337 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PITX1P78337 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PITX1P78337 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PITX1P78337 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PITX1P78337 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PITX1P78337 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PITX1P78337 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PITX1P78337 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PITX1P78337 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PITX1P78337 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PITX1P78337 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PITX1P78337 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PITX1P78337 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PITX1P78337 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PITX1P78337 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PITX1P78337 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PITX1P78337 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PITX1P78337 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PITX1P78337 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PITX1P78337 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PITX1P78337 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PITX1P78337 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PITX1P78337 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PITX1P78337 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PITX1P78337 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PITX1P78337 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PITX1P78337 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PITX1P78337 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PITX1P78337 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PITX1P78337 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PITX1P78337 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PITX1P78337 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PITX1P78337 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PITX1P78337 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PITX1P78337 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PITX1P78337 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PITX1P78337 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PITX1P78337 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PITX1P78337 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PITX1P78337 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PITX1P78337 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PITX1P78337 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PITX1P78337 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PITX1P78337 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PITX1P78337 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PITX1P78337 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PITX1P78337 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PITX1P78337 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PITX1P78337 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PITX1P78337 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PITX1P78337 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PITX1P78337 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PITX1P78337 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PITX1P78337 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PITX1P78337 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PITX1P78337 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PITX1P78337 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PITX1P78337 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PITX1P78337 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PITX1P78337 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PITX1P78337 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PITX1P78337 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PITX1P78337 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PITX1P78337 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PITX1P78337 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PITX1P78337 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PITX1P78337 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PITX1P78337 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PITX1P78337 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PITX1P78337 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PITX1P78337 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PITX1P78337 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PITX1P78337 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PITX1P78337 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PITX1P78337 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PITX1P78337 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms