Protein–RNA interactions for Protein: P69905

HBA1, Hemoglobin subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBA1P69905 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HBA1P69905 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HBA1P69905 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HBA1P69905 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HBA1P69905 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HBA1P69905 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HBA1P69905 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HBA1P69905 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HBA1P69905 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HBA1P69905 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HBA1P69905 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HBA1P69905 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HBA1P69905 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HBA1P69905 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HBA1P69905 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HBA1P69905 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HBA1P69905 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HBA1P69905 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HBA1P69905 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HBA1P69905 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HBA1P69905 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HBA1P69905 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HBA1P69905 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HBA1P69905 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HBA1P69905 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HBA1P69905 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HBA1P69905 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HBA1P69905 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HBA1P69905 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HBA1P69905 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HBA1P69905 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HBA1P69905 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HBA1P69905 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HBA1P69905 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HBA1P69905 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HBA1P69905 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HBA1P69905 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HBA1P69905 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HBA1P69905 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HBA1P69905 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HBA1P69905 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HBA1P69905 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HBA1P69905 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HBA1P69905 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HBA1P69905 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HBA1P69905 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HBA1P69905 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HBA1P69905 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HBA1P69905 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HBA1P69905 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HBA1P69905 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HBA1P69905 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HBA1P69905 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HBA1P69905 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HBA1P69905 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HBA1P69905 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HBA1P69905 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HBA1P69905 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HBA1P69905 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HBA1P69905 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HBA1P69905 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HBA1P69905 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HBA1P69905 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HBA1P69905 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HBA1P69905 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HBA1P69905 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HBA1P69905 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HBA1P69905 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HBA1P69905 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HBA1P69905 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HBA1P69905 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HBA1P69905 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HBA1P69905 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HBA1P69905 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HBA1P69905 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HBA1P69905 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HBA1P69905 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HBA1P69905 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HBA1P69905 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HBA1P69905 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HBA1P69905 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HBA1P69905 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HBA1P69905 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HBA1P69905 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HBA1P69905 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HBA1P69905 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HBA1P69905 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HBA1P69905 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HBA1P69905 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HBA1P69905 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HBA1P69905 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HBA1P69905 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HBA1P69905 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HBA1P69905 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HBA1P69905 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HBA1P69905 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HBA1P69905 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HBA1P69905 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HBA1P69905 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HBA1P69905 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms