Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACTG1P63261 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACTG1P63261 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACTG1P63261 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACTG1P63261 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTG1P63261 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTG1P63261 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTG1P63261 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTG1P63261 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTG1P63261 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTG1P63261 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTG1P63261 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTG1P63261 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTG1P63261 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTG1P63261 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTG1P63261 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTG1P63261 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACTG1P63261 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACTG1P63261 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACTG1P63261 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACTG1P63261 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTG1P63261 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTG1P63261 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTG1P63261 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTG1P63261 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTG1P63261 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTG1P63261 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTG1P63261 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTG1P63261 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTG1P63261 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTG1P63261 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTG1P63261 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACTG1P63261 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACTG1P63261 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACTG1P63261 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACTG1P63261 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACTG1P63261 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTG1P63261 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTG1P63261 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTG1P63261 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ACTG1P63261 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ACTG1P63261 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTG1P63261 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTG1P63261 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTG1P63261 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTG1P63261 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTG1P63261 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACTG1P63261 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACTG1P63261 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ACTG1P63261 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ACTG1P63261 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ACTG1P63261 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ACTG1P63261 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTG1P63261 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTG1P63261 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTG1P63261 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTG1P63261 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTG1P63261 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTG1P63261 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTG1P63261 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTG1P63261 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTG1P63261 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTG1P63261 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTG1P63261 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTG1P63261 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTG1P63261 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTG1P63261 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTG1P63261 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTG1P63261 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTG1P63261 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTG1P63261 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTG1P63261 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTG1P63261 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTG1P63261 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTG1P63261 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTG1P63261 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTG1P63261 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTG1P63261 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTG1P63261 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTG1P63261 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTG1P63261 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTG1P63261 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTG1P63261 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTG1P63261 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTG1P63261 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTG1P63261 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTG1P63261 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTG1P63261 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTG1P63261 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTG1P63261 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTG1P63261 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTG1P63261 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTG1P63261 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTG1P63261 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTG1P63261 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTG1P63261 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTG1P63261 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTG1P63261 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTG1P63261 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTG1P63261 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms