Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTA2P62736 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTA2P62736 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTA2P62736 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTA2P62736 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTA2P62736 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTA2P62736 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTA2P62736 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTA2P62736 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTA2P62736 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTA2P62736 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTA2P62736 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTA2P62736 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTA2P62736 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTA2P62736 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTA2P62736 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTA2P62736 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTA2P62736 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTA2P62736 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTA2P62736 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTA2P62736 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTA2P62736 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTA2P62736 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTA2P62736 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTA2P62736 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTA2P62736 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTA2P62736 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTA2P62736 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTA2P62736 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTA2P62736 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTA2P62736 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTA2P62736 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTA2P62736 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTA2P62736 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTA2P62736 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTA2P62736 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTA2P62736 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTA2P62736 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTA2P62736 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTA2P62736 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTA2P62736 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTA2P62736 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTA2P62736 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTA2P62736 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTA2P62736 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTA2P62736 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTA2P62736 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTA2P62736 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTA2P62736 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTA2P62736 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTA2P62736 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTA2P62736 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTA2P62736 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTA2P62736 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTA2P62736 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTA2P62736 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTA2P62736 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTA2P62736 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTA2P62736 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTA2P62736 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTA2P62736 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTA2P62736 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTA2P62736 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTA2P62736 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTA2P62736 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTA2P62736 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTA2P62736 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTA2P62736 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTA2P62736 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTA2P62736 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTA2P62736 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTA2P62736 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTA2P62736 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTA2P62736 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTA2P62736 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTA2P62736 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTA2P62736 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTA2P62736 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTA2P62736 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTA2P62736 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTA2P62736 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTA2P62736 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTA2P62736 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ACTA2P62736 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTA2P62736 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTA2P62736 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTA2P62736 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTA2P62736 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTA2P62736 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTA2P62736 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTA2P62736 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTA2P62736 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTA2P62736 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTA2P62736 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTA2P62736 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTA2P62736 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTA2P62736 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTA2P62736 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTA2P62736 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTA2P62736 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms