Protein–RNA interactions for Protein: P62318

SNRPD3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD3P62318 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNRPD3P62318 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNRPD3P62318 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNRPD3P62318 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNRPD3P62318 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNRPD3P62318 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNRPD3P62318 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNRPD3P62318 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNRPD3P62318 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNRPD3P62318 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNRPD3P62318 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNRPD3P62318 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNRPD3P62318 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SNRPD3P62318 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNRPD3P62318 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNRPD3P62318 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNRPD3P62318 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNRPD3P62318 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SNRPD3P62318 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNRPD3P62318 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNRPD3P62318 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNRPD3P62318 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNRPD3P62318 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNRPD3P62318 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNRPD3P62318 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNRPD3P62318 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNRPD3P62318 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNRPD3P62318 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPD3P62318 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPD3P62318 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPD3P62318 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPD3P62318 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPD3P62318 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPD3P62318 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPD3P62318 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPD3P62318 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPD3P62318 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPD3P62318 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPD3P62318 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPD3P62318 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPD3P62318 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPD3P62318 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPD3P62318 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPD3P62318 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPD3P62318 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPD3P62318 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPD3P62318 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPD3P62318 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPD3P62318 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPD3P62318 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPD3P62318 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPD3P62318 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPD3P62318 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPD3P62318 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNRPD3P62318 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SNRPD3P62318 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPD3P62318 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPD3P62318 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPD3P62318 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPD3P62318 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPD3P62318 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPD3P62318 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPD3P62318 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPD3P62318 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPD3P62318 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPD3P62318 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPD3P62318 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPD3P62318 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPD3P62318 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPD3P62318 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPD3P62318 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPD3P62318 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPD3P62318 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPD3P62318 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPD3P62318 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPD3P62318 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPD3P62318 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPD3P62318 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPD3P62318 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPD3P62318 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPD3P62318 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPD3P62318 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPD3P62318 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPD3P62318 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPD3P62318 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPD3P62318 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPD3P62318 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPD3P62318 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPD3P62318 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPD3P62318 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPD3P62318 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPD3P62318 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPD3P62318 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPD3P62318 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPD3P62318 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPD3P62318 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPD3P62318 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPD3P62318 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPD3P62318 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPD3P62318 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms