Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVFC1P60507 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVFC1P60507 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVFC1P60507 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVFC1P60507 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVFC1P60507 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVFC1P60507 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVFC1P60507 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVFC1P60507 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVFC1P60507 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERVFC1P60507 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERVFC1P60507 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERVFC1P60507 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERVFC1P60507 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERVFC1P60507 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERVFC1P60507 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERVFC1P60507 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERVFC1P60507 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVFC1P60507 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVFC1P60507 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVFC1P60507 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVFC1P60507 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVFC1P60507 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVFC1P60507 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVFC1P60507 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVFC1P60507 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVFC1P60507 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVFC1P60507 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVFC1P60507 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVFC1P60507 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVFC1P60507 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVFC1P60507 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVFC1P60507 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVFC1P60507 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVFC1P60507 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVFC1P60507 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVFC1P60507 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVFC1P60507 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVFC1P60507 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVFC1P60507 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVFC1P60507 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVFC1P60507 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVFC1P60507 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVFC1P60507 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVFC1P60507 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVFC1P60507 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVFC1P60507 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVFC1P60507 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ERVFC1P60507 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERVFC1P60507 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERVFC1P60507 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERVFC1P60507 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ERVFC1P60507 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ERVFC1P60507 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ERVFC1P60507 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVFC1P60507 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVFC1P60507 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVFC1P60507 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVFC1P60507 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVFC1P60507 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVFC1P60507 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVFC1P60507 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVFC1P60507 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVFC1P60507 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVFC1P60507 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVFC1P60507 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVFC1P60507 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVFC1P60507 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVFC1P60507 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVFC1P60507 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVFC1P60507 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVFC1P60507 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVFC1P60507 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVFC1P60507 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVFC1P60507 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVFC1P60507 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVFC1P60507 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVFC1P60507 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVFC1P60507 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVFC1P60507 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERVFC1P60507 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERVFC1P60507 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERVFC1P60507 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERVFC1P60507 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERVFC1P60507 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERVFC1P60507 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERVFC1P60507 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERVFC1P60507 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERVFC1P60507 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERVFC1P60507 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ERVFC1P60507 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERVFC1P60507 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERVFC1P60507 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERVFC1P60507 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERVFC1P60507 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERVFC1P60507 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERVFC1P60507 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERVFC1P60507 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERVFC1P60507 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERVFC1P60507 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.8 ms