Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DCDC1P59894 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCDC1P59894 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCDC1P59894 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCDC1P59894 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCDC1P59894 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DCDC1P59894 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCDC1P59894 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCDC1P59894 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCDC1P59894 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCDC1P59894 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCDC1P59894 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCDC1P59894 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCDC1P59894 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCDC1P59894 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCDC1P59894 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCDC1P59894 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCDC1P59894 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCDC1P59894 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCDC1P59894 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DCDC1P59894 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DCDC1P59894 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DCDC1P59894 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DCDC1P59894 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCDC1P59894 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCDC1P59894 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DCDC1P59894 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DCDC1P59894 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DCDC1P59894 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DCDC1P59894 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCDC1P59894 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCDC1P59894 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
DCDC1P59894 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
DCDC1P59894 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
DCDC1P59894 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCDC1P59894 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCDC1P59894 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCDC1P59894 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCDC1P59894 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCDC1P59894 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DCDC1P59894 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCDC1P59894 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCDC1P59894 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DCDC1P59894 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DCDC1P59894 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DCDC1P59894 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DCDC1P59894 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DCDC1P59894 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DCDC1P59894 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DCDC1P59894 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCDC1P59894 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCDC1P59894 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCDC1P59894 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCDC1P59894 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCDC1P59894 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCDC1P59894 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCDC1P59894 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCDC1P59894 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCDC1P59894 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCDC1P59894 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCDC1P59894 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCDC1P59894 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCDC1P59894 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCDC1P59894 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCDC1P59894 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCDC1P59894 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCDC1P59894 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DCDC1P59894 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DCDC1P59894 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DCDC1P59894 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DCDC1P59894 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DCDC1P59894 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DCDC1P59894 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DCDC1P59894 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCDC1P59894 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCDC1P59894 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCDC1P59894 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCDC1P59894 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCDC1P59894 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCDC1P59894 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCDC1P59894 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCDC1P59894 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCDC1P59894 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCDC1P59894 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCDC1P59894 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DCDC1P59894 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCDC1P59894 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCDC1P59894 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCDC1P59894 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCDC1P59894 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCDC1P59894 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DCDC1P59894 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCDC1P59894 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCDC1P59894 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCDC1P59894 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCDC1P59894 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCDC1P59894 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCDC1P59894 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCDC1P59894 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCDC1P59894 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms