Protein–RNA interactions for Protein: P57678

GEMIN4, Gem-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMIN4P57678 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GEMIN4P57678 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GEMIN4P57678 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GEMIN4P57678 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GEMIN4P57678 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GEMIN4P57678 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GEMIN4P57678 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GEMIN4P57678 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GEMIN4P57678 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GEMIN4P57678 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GEMIN4P57678 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GEMIN4P57678 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GEMIN4P57678 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GEMIN4P57678 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GEMIN4P57678 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GEMIN4P57678 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GEMIN4P57678 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GEMIN4P57678 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GEMIN4P57678 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GEMIN4P57678 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GEMIN4P57678 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GEMIN4P57678 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GEMIN4P57678 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GEMIN4P57678 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GEMIN4P57678 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GEMIN4P57678 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GEMIN4P57678 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GEMIN4P57678 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GEMIN4P57678 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GEMIN4P57678 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GEMIN4P57678 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GEMIN4P57678 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GEMIN4P57678 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GEMIN4P57678 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GEMIN4P57678 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GEMIN4P57678 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GEMIN4P57678 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GEMIN4P57678 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GEMIN4P57678 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GEMIN4P57678 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GEMIN4P57678 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GEMIN4P57678 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GEMIN4P57678 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GEMIN4P57678 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GEMIN4P57678 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GEMIN4P57678 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GEMIN4P57678 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GEMIN4P57678 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GEMIN4P57678 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GEMIN4P57678 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GEMIN4P57678 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GEMIN4P57678 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GEMIN4P57678 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GEMIN4P57678 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GEMIN4P57678 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GEMIN4P57678 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GEMIN4P57678 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GEMIN4P57678 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GEMIN4P57678 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GEMIN4P57678 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GEMIN4P57678 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GEMIN4P57678 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GEMIN4P57678 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GEMIN4P57678 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GEMIN4P57678 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GEMIN4P57678 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GEMIN4P57678 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GEMIN4P57678 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GEMIN4P57678 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GEMIN4P57678 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GEMIN4P57678 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GEMIN4P57678 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GEMIN4P57678 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GEMIN4P57678 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GEMIN4P57678 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GEMIN4P57678 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GEMIN4P57678 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GEMIN4P57678 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GEMIN4P57678 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GEMIN4P57678 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GEMIN4P57678 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GEMIN4P57678 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GEMIN4P57678 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GEMIN4P57678 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GEMIN4P57678 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GEMIN4P57678 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GEMIN4P57678 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GEMIN4P57678 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GEMIN4P57678 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GEMIN4P57678 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GEMIN4P57678 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GEMIN4P57678 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GEMIN4P57678 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GEMIN4P57678 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GEMIN4P57678 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GEMIN4P57678 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GEMIN4P57678 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GEMIN4P57678 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GEMIN4P57678 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GEMIN4P57678 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms