Protein–RNA interactions for Protein: P57087

JAM2, Junctional adhesion molecule B, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAM2P57087 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
JAM2P57087 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
JAM2P57087 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
JAM2P57087 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
JAM2P57087 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
JAM2P57087 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
JAM2P57087 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
JAM2P57087 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
JAM2P57087 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
JAM2P57087 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
JAM2P57087 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
JAM2P57087 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
JAM2P57087 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
JAM2P57087 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
JAM2P57087 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
JAM2P57087 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
JAM2P57087 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
JAM2P57087 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
JAM2P57087 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
JAM2P57087 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
JAM2P57087 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
JAM2P57087 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
JAM2P57087 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
JAM2P57087 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
JAM2P57087 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
JAM2P57087 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
JAM2P57087 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
JAM2P57087 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
JAM2P57087 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
JAM2P57087 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
JAM2P57087 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
JAM2P57087 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
JAM2P57087 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
JAM2P57087 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
JAM2P57087 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
JAM2P57087 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
JAM2P57087 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
JAM2P57087 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
JAM2P57087 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
JAM2P57087 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
JAM2P57087 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
JAM2P57087 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
JAM2P57087 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
JAM2P57087 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
JAM2P57087 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
JAM2P57087 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
JAM2P57087 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
JAM2P57087 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
JAM2P57087 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
JAM2P57087 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
JAM2P57087 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
JAM2P57087 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
JAM2P57087 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
JAM2P57087 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
JAM2P57087 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
JAM2P57087 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
JAM2P57087 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
JAM2P57087 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
JAM2P57087 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
JAM2P57087 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
JAM2P57087 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
JAM2P57087 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
JAM2P57087 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
JAM2P57087 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
JAM2P57087 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
JAM2P57087 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
JAM2P57087 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
JAM2P57087 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
JAM2P57087 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
JAM2P57087 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
JAM2P57087 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
JAM2P57087 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
JAM2P57087 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
JAM2P57087 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
JAM2P57087 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
JAM2P57087 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
JAM2P57087 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
JAM2P57087 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
JAM2P57087 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
JAM2P57087 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
JAM2P57087 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
JAM2P57087 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
JAM2P57087 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
JAM2P57087 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
JAM2P57087 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
JAM2P57087 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
JAM2P57087 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
JAM2P57087 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
JAM2P57087 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
JAM2P57087 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
JAM2P57087 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
JAM2P57087 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
JAM2P57087 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
JAM2P57087 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
JAM2P57087 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
JAM2P57087 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
JAM2P57087 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
JAM2P57087 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
JAM2P57087 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
JAM2P57087 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms