Protein–RNA interactions for Protein: P57073

SOX8, Transcription factor SOX-8, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX8P57073 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX8P57073 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX8P57073 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX8P57073 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX8P57073 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX8P57073 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX8P57073 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX8P57073 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX8P57073 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX8P57073 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX8P57073 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX8P57073 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX8P57073 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX8P57073 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX8P57073 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX8P57073 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX8P57073 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX8P57073 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX8P57073 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX8P57073 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX8P57073 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX8P57073 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX8P57073 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX8P57073 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX8P57073 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX8P57073 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX8P57073 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX8P57073 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX8P57073 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX8P57073 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX8P57073 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX8P57073 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX8P57073 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX8P57073 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX8P57073 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX8P57073 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX8P57073 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX8P57073 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX8P57073 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX8P57073 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX8P57073 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX8P57073 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX8P57073 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX8P57073 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX8P57073 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX8P57073 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX8P57073 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX8P57073 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX8P57073 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX8P57073 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX8P57073 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX8P57073 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX8P57073 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SOX8P57073 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX8P57073 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX8P57073 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX8P57073 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX8P57073 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX8P57073 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX8P57073 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX8P57073 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX8P57073 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX8P57073 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX8P57073 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX8P57073 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX8P57073 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX8P57073 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX8P57073 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX8P57073 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX8P57073 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX8P57073 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX8P57073 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX8P57073 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX8P57073 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX8P57073 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX8P57073 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX8P57073 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX8P57073 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX8P57073 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX8P57073 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX8P57073 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX8P57073 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX8P57073 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX8P57073 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX8P57073 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX8P57073 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX8P57073 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX8P57073 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX8P57073 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX8P57073 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX8P57073 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX8P57073 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX8P57073 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX8P57073 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX8P57073 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX8P57073 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX8P57073 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX8P57073 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SOX8P57073 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SOX8P57073 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms