Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GSCP56915 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GSCP56915 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GSCP56915 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GSCP56915 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GSCP56915 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GSCP56915 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GSCP56915 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GSCP56915 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GSCP56915 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GSCP56915 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GSCP56915 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GSCP56915 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GSCP56915 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GSCP56915 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GSCP56915 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GSCP56915 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GSCP56915 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GSCP56915 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GSCP56915 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GSCP56915 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GSCP56915 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GSCP56915 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GSCP56915 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GSCP56915 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
GSCP56915 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GSCP56915 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GSCP56915 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GSCP56915 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GSCP56915 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GSCP56915 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GSCP56915 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GSCP56915 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GSCP56915 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GSCP56915 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GSCP56915 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GSCP56915 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GSCP56915 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GSCP56915 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GSCP56915 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GSCP56915 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GSCP56915 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GSCP56915 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GSCP56915 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GSCP56915 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GSCP56915 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GSCP56915 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GSCP56915 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GSCP56915 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GSCP56915 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GSCP56915 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GSCP56915 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GSCP56915 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GSCP56915 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GSCP56915 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GSCP56915 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GSCP56915 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GSCP56915 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GSCP56915 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GSCP56915 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GSCP56915 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GSCP56915 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GSCP56915 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GSCP56915 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GSCP56915 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GSCP56915 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GSCP56915 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GSCP56915 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GSCP56915 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GSCP56915 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GSCP56915 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GSCP56915 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GSCP56915 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GSCP56915 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GSCP56915 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GSCP56915 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GSCP56915 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GSCP56915 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GSCP56915 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GSCP56915 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GSCP56915 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GSCP56915 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GSCP56915 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GSCP56915 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GSCP56915 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GSCP56915 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GSCP56915 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GSCP56915 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GSCP56915 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GSCP56915 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GSCP56915 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GSCP56915 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GSCP56915 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GSCP56915 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GSCP56915 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GSCP56915 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GSCP56915 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GSCP56915 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GSCP56915 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GSCP56915 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms