Protein–RNA interactions for Protein: P56880

CLDN20, Claudin-20, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN20P56880 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN20P56880 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN20P56880 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN20P56880 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN20P56880 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN20P56880 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN20P56880 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN20P56880 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN20P56880 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN20P56880 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN20P56880 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN20P56880 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN20P56880 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN20P56880 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN20P56880 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN20P56880 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN20P56880 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN20P56880 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN20P56880 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN20P56880 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN20P56880 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN20P56880 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN20P56880 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN20P56880 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN20P56880 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN20P56880 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN20P56880 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN20P56880 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN20P56880 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN20P56880 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN20P56880 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN20P56880 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN20P56880 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN20P56880 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN20P56880 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN20P56880 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN20P56880 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN20P56880 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN20P56880 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN20P56880 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN20P56880 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN20P56880 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN20P56880 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN20P56880 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN20P56880 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN20P56880 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN20P56880 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN20P56880 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN20P56880 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN20P56880 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN20P56880 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN20P56880 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN20P56880 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN20P56880 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN20P56880 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN20P56880 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN20P56880 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN20P56880 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN20P56880 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN20P56880 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLDN20P56880 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN20P56880 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN20P56880 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN20P56880 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN20P56880 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN20P56880 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN20P56880 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN20P56880 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN20P56880 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN20P56880 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN20P56880 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN20P56880 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN20P56880 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN20P56880 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN20P56880 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN20P56880 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN20P56880 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN20P56880 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN20P56880 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN20P56880 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN20P56880 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN20P56880 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN20P56880 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN20P56880 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN20P56880 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN20P56880 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN20P56880 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN20P56880 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN20P56880 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN20P56880 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN20P56880 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN20P56880 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN20P56880 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN20P56880 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN20P56880 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN20P56880 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN20P56880 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN20P56880 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN20P56880 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN20P56880 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms