Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BACE1P56817 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BACE1P56817 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BACE1P56817 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BACE1P56817 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BACE1P56817 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BACE1P56817 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BACE1P56817 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BACE1P56817 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BACE1P56817 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BACE1P56817 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BACE1P56817 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BACE1P56817 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BACE1P56817 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
BACE1P56817 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
BACE1P56817 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
BACE1P56817 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BACE1P56817 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BACE1P56817 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BACE1P56817 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BACE1P56817 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BACE1P56817 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BACE1P56817 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
BACE1P56817 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BACE1P56817 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BACE1P56817 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BACE1P56817 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BACE1P56817 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
BACE1P56817 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BACE1P56817 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BACE1P56817 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BACE1P56817 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BACE1P56817 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BACE1P56817 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BACE1P56817 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
BACE1P56817 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BACE1P56817 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
BACE1P56817 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BACE1P56817 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BACE1P56817 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BACE1P56817 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BACE1P56817 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BACE1P56817 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BACE1P56817 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BACE1P56817 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
BACE1P56817 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
BACE1P56817 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BACE1P56817 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BACE1P56817 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
BACE1P56817 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BACE1P56817 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
BACE1P56817 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BACE1P56817 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BACE1P56817 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BACE1P56817 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BACE1P56817 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BACE1P56817 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BACE1P56817 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BACE1P56817 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BACE1P56817 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BACE1P56817 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BACE1P56817 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BACE1P56817 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BACE1P56817 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BACE1P56817 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BACE1P56817 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BACE1P56817 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BACE1P56817 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BACE1P56817 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BACE1P56817 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BACE1P56817 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
BACE1P56817 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BACE1P56817 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BACE1P56817 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BACE1P56817 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BACE1P56817 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BACE1P56817 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
BACE1P56817 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BACE1P56817 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BACE1P56817 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BACE1P56817 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BACE1P56817 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BACE1P56817 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BACE1P56817 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BACE1P56817 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BACE1P56817 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BACE1P56817 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BACE1P56817 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
BACE1P56817 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
BACE1P56817 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
BACE1P56817 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BACE1P56817 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BACE1P56817 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BACE1P56817 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
BACE1P56817 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BACE1P56817 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BACE1P56817 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BACE1P56817 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BACE1P56817 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BACE1P56817 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms